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J-GLOBAL ID：201702272830769451   整理番号：17A1793852

配列と構造特性に基づく蛋白質自由エネルギー予測【JST・京大機械翻訳】

Protein Free Energy Prediction based on Sequence and Structure Features

著者 (4件)： Lu Bangli (广西大学計算机与電子信息学院,广西南寧,530004) ,  Chen Qingfeng (广西大学計算机与電子信息学院,广西南寧 530004;广西大学亜熱帯農業生物資源保護与利用国家重点実験室,广西南寧 530004) ,  Jiang Jiawen (广西大学計算机与電子信息学院,广西南寧,530004) ,  Luo Haiqiong (广西医科大学信息与管理学院,广西南寧,530021)
資料名： Guangxi Kexue  (Guangxi Kexue)
巻： 24  号： 3  ページ： 286-291  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3211A  ISSN： 1005-9164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]蛋白質の自由エネルギーは蛋白質の相互作用を正確に反映するだけでなく、薬物の設計に対しても大きい助けを与えることができる。そのため、正確なタンパク質自由エネルギー回帰モデルを選択することは非常に必要である。[方法]135の蛋白質複合体を収集し、600の特徴を計算し、最小冗長最大相関(mRMR)を用いて、タンパク質自由エネルギーと顕著な相関特徴を選択し、冗長特徴を除去し、最小冗長最大相関の特徴集合を獲得し、選別後の特徴を用いて6種類の回帰モデルを構築した。選択された特徴に対して、比較分析を行い、特徴の重要性を分析した。最後に,10の交差検証法を用いて,最適モデルを得て,蛋白質自由エネルギーを予測した。[結果]他の方法に対して、本研究で確立したモデルは135のタンパク質複合体の性能を予測し、その他の方法に対して比較的高い相関係数と低い平均絶対誤差がある。[結論]本実験で用いた方法は,他の方法により選択したモデルよりも良好な予測精度を示した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *タンパク質 ,  相関係数 ,  回帰モデル ,  交差検証法 ,  *自由エネルギー ,  *予測 ,  *構造特性 ,  タンパク質複合体
準シソーラス用語： 予測精度 ,  比較分析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： protein interaction ,  free energy ,  feature selection ,  regression model

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 構造特性 ,  蛋白質 ,  自由エネルギー ,  予測