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J-GLOBAL ID:201702272895745748   整理番号:17A1099083

血液の年齢予測のためのDNAに基づくアプローチの独立検証【Powered by NICT】

Independent validation of DNA-based approaches for age prediction in blood
著者 (9件):
資料名:
巻: 29  ページ: 250-256  発行年: 2017年 
JST資料番号: W3148A  ISSN: 1872-4973  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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多くの分子バイオマーカーは暦年齢の予測因子として提案されている。それらの中で,T細胞特異的DNA再配列とDNAメチル化マーカーは,それらの高い予測精度のために血液での法医学的年齢予測因子として導入されている。これらのマーカーは,非常に有望なようであるが,法医学ケースワーク試料の分析に良く応用のために提案されたマーカーと遺伝子型決定法は,試験しなければならない。本研究では,シグナルジョイントT細胞受容体切除サークル(sjTRECs)とELOVL2,C1orf132,TRIM59,KLF14,FHL2遺伝子に位置するDNAメチル化マーカーは,100人の韓国人血試料中の再解析暦年齢との関連を試験するために,以前の報告で用いた同じ分析プラットフォームを用いた。著者らの研究は,100人の韓国人の独立検証セットにおける5遺伝子のsjTRECとDNAメチル化マーカーの年齢関連試験を再現し,以前のモデルの年齢予測性能はいろいろな住民グループにわたる相対的に一致したことを証明した。しかし,特定のCpG遺伝子座における年齢関連の程度は韓国とポーランドの集団における同一なかった;,いくつかの年齢予測モデルは,ここで得られたデータを用いて再訓練した。DNAメチル化及び/又はsjTRECデータと再訓練3モデルのすべては共通してELOVL2とFHL2遺伝子から各CpG部位を有しており,以前に報告されたモデルよりも優れた予測精度を生成した。訓練データとテストデータが同一の場合には,これは再訓練されたモデルは,既存のデータを良く適合し,計算した予測精度は高い可能性があるという事実に起因する。しかし,異なるタイプのマーカーの組み合わせ,すなわち,sjTRECとDNAメチル化は,最高齢群における予測精度を改善したことは注目に値する。著者らの研究は,提案したマーカーの有用性と独立したデータセットで遺伝子型決定法を実証し,予測精度を改善するために異なるタイプのDNAマーカーを組み合わせる可能性を示唆した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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核酸一般 
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