文献

J-GLOBAL ID：201702274120634474   整理番号：17A1445214

脂質生成に沿ったゲノム構成における転写因子とクロマチン構造のための階層的役割【Powered by NICT】

Hierarchical role for transcription factors and chromatin structure in genome organization along adipogenesis

著者 (8件)： Sarusi Portuguez Avital (The Mina and Everard Goodman Faculty of Life Sciences, Bar Ilan University, Ramat Gan, Israel) ,  Schwartz Michal (The Mina and Everard Goodman Faculty of Life Sciences, Bar Ilan University, Ramat Gan, Israel) ,  Siersbaek Rasmus (Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Southern Denmark, Odense, Denmark) ,  Nielsen Ronni (Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Southern Denmark, Odense, Denmark) ,  Sung Myong-Hee (Laboratory of Molecular Biology and Immunology, NIA, National Institutes of Health, Baltimore, MD, USA) ,  Mandrup Susanne (Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Southern Denmark, Odense, Denmark) ,  Kaplan Tommy (School of Computer Science and Engineering, The Hebrew University of Jerusalem, Jerusalem, Israel) ,  Hakim Ofir (The Mina and Everard Goodman Faculty of Life Sciences, Bar Ilan University, Ramat Gan, Israel)
資料名： FEBS Journal  (FEBS Journal)
巻： 284  号： 19  ページ： 3230-3244  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0206B  ISSN： 1742-464X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 哺乳類ゲノムの三次元折畳みは細胞型特異的である,変更,遺伝子調節の重要な成分であることを示唆することは困難である。しかし,多数のクロマチン会合因子の,脂肪細胞における転写プログラムの調節に積極的な染色体ドメインの共局在とこの組織の役割を駆動する機構は明らかではない。全ゲノム染色体対合の解析は3T3-L1細胞における脂肪生成遺伝子の細胞型特異的空間クラスタリングを明らかにした。時間経過分析は,PPARγとLpin1により採取し,脂肪生成「ハブ」は脂肪生成中に組織化された再編成を受けることを示した。ゲノム構造の動力学の結合複数のクロマチンデータセットで試験した全ての転写因子(TF)の中で,RXRは脂肪細胞化開始のゲノム再編成の中心であることを示した。興味深いことに,分化の終わりに,脂肪生成ハブは遺伝子転写の減衰と結合したH3K27me3抑制環境にシフトした。脂肪生成遺伝的プログラムをまとめるということに脂肪生成ゲノム構造の確立に寄与するTFの活性の段階特異的階層を提案した。添加では,分化の終わりにH3K27me3に富む環境におけるこのネットワークの再配置は,遺伝子転写レベルの安定化に寄与し,これらの特殊化した細胞の発生可塑性を低下させる可能性がある。データベース:本論文で報告されている全ての配列データは,GEO(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)(GSE92475)で堆積した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *転写因子 ,  ネットワーク ,  立体配座 ,  再編成 ,  *クロマチン ,  *リポゲネシス ,  脂肪細胞 ,  哺乳類 ,  塑性 ,  *ゲノム ,  データベース ,  PPARγ ,  遺伝的調節
準シソーラス用語： 3T3-L1細胞 ,  細胞型 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 脂質生成 ,  染色体立体配座 ,  転写 ,  転写因子

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 脂質生成 ,  ゲノム構成 ,  転写因子 ,  クロマチン構造 ,  役割