深度の低いカバー率の次世代シークエンシングデータから完全ミトゲノムシークエンスを推測するための補完アプローチ

MIZUNO Fuzuki; MIZUNO Fuzuki; KUMAGAI Masahiko; KUROSAKI Kunihiko; HAYASHI Michiko; SUGIYAMA Saburo; UEDA Shintaroh; UEDA Shintaroh; WANG Li

文献

J-GLOBAL ID：201702274542687735 整理番号：17A0744035

深度の低いカバー率の次世代シークエンシングデータから完全ミトゲノムシークエンスを推測するための補完アプローチ

Imputation approach for deducing a complete mitogenome sequence from low-depth-coverage next-generation sequencing data: application to ancient remains from the Moon Pyramid, Mexico

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著者 (9件)： , , , , , , , ,
資料名：
巻： 62 号： 6 ページ： 631-635 発行年： 2017年06月
JST資料番号： Z0756A ISSN： 1434-5161 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

ミトゲノムの信頼できる完全ヌクレオチドシークエンスを得るため...

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遺伝子の構造と化学 , 人類学

引用文献 (32件)：

Smith, D. R. The past, present and future of mitochondrial genomics: have we sequenced enough mtDNAs?. Brief Funct. Genomics 15, 47-54 (2016).
Mizuno, F., Gojobori, J., Wang, L., Onishi, K., Sugiyama, S., Granados, J. et al. Complete mitogenome analysis of indigenous populations in Mexico: its relevance for the origin of Mesoamericans. J. Hum. Genet. 59, 359-367 (2014).
Gojobori, J., Mizuno, F., Wang, L., Onishi, K., Granados, J., Gomez-Trejo, C. et al. mtDNA diversity of the Zapotec in Mexico suggests a population decline long before the first contact with Europeans. J. Hum. Genet. 160, 557-559 (2015).
Adler, C. J., Haak, W., Donlon, D. & Cooper, A. Survival and recovery of DNA from ancient teeth and bones. J. Arch. Sci. 38, 956-964 (2011).
Reed, F. A., Kontanis, E. J., Kennedy, K. A. & Aquadro, C. F. Brief communication: ancient DNA prospects from Sri Lankan highland dry caves support an emerging global pattern. Am. J. Phys. Anthropol. 121, 112-116 (2003).

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