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J-GLOBAL ID：201702275117921972   整理番号：17A1181472

CO_2~濃縮草地生態系における窒素循環経路のメタゲノム再構成【Powered by NICT】

Metagenomic reconstruction of nitrogen cycling pathways in a CO₂-enriched grassland ecosystem

著者 (13件)： Tu Qichao (Department of Marine Sciences, Ocean College, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Tu Qichao (Institute for Environmental Genomics, Department of Microbiology & Plant Biology, School of Civil Engineering and Environmental Sciences, University of Oklahoma, Norman, OK, USA) ,  He Zhili (Institute for Environmental Genomics, Department of Microbiology & Plant Biology, School of Civil Engineering and Environmental Sciences, University of Oklahoma, Norman, OK, USA) ,  Wu Liyou (Institute for Environmental Genomics, Department of Microbiology & Plant Biology, School of Civil Engineering and Environmental Sciences, University of Oklahoma, Norman, OK, USA) ,  Xue Kai (Institute for Environmental Genomics, Department of Microbiology & Plant Biology, School of Civil Engineering and Environmental Sciences, University of Oklahoma, Norman, OK, USA) ,  Xie Gary (BioScience Division, Los Alamos National Lab, Los Alamos, NM, USA) ,  Chain Patrick (BioScience Division, Los Alamos National Lab, Los Alamos, NM, USA) ,  Reich Peter B. (Department of Forest Resources, University of Minnesota, St. Paul, Minnesota, USA) ,  Reich Peter B. (Hawkesbury Institute for the Environment, Western Sydney University, Richmond 2753, NSW, Australia) ,  Hobbie Sarah E. (Department of Ecology, Evolution, and Behavior, University of Minnesota, St. Paul, Minnesota, USA) ,  Zhou Jizhong (Institute for Environmental Genomics, Department of Microbiology & Plant Biology, School of Civil Engineering and Environmental Sciences, University of Oklahoma, Norman, OK, USA) ,  Zhou Jizhong (Earth and Environmental Sciences, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, USA) ,  Zhou Jizhong (State Key Joint Laboratory of Environment Simulation and Pollution Control, School of Environment, Tsinghua University, Beijing, China)
資料名： Soil Biology & Biochemistry  (Soil Biology & Biochemistry)
巻： 106  ページ： 99-108  発行年： 2017年 
JST資料番号： D0628A  ISSN： 0038-0717  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 窒素(N)サイクルは微生物群集により仲介される重要な生物地球化学的経路の収集であり,多くの陸上生態系におけるCO_2の増加への応答での重要な制約である。これまでの研究は,主にPCR,蛋白質分析と機能的遺伝子アレイによるいくつかの遺伝子ファミリーに焦点を当て微生物遺伝学的データに対する土壌N循環を関係づける,全Nサイクルあまり理解されていないに関与する土壌微生物の分類学的および機能的組成を脱離することを試みる。本研究では,2009年の長期実験サイト,BioCONから採取した24土壌試料。>12年間の上昇CO_2(eCO_2)に曝露された草地における土壌N循環に関与する微生物遺伝子ファミリーを調査したショットガンメタゲノム配列決定アプローチ。長期eCO_2への主要なN循環遺伝子ファミリーの応答を評価することに加えて,ここではまた,土壌N形態変化に関与するこれらの遺伝子ファミリーの分類学的および機能的組成を特性化することを目的とした。分類学的レベルでは,有機N代謝と硝酸塩還元は関与する最も多様な微生物種を有していた。異なるN循環過程の明確な分類学的組成は,自然生態系における複雑なN循環は多くの異なる微生物による複数のプロセスの結果であることを示唆した。N循環を仲介する地下微生物群集はいくつかの異なる方法でeCO_2,有機物分解,異化型硝酸還元,N_2固定に関連する遺伝子ファミリーの誘導量を含むに応答し,グルタミン合成とanammoxの遺伝子ファミリーの存在量を抑制した。本研究は,複雑な生態系におけるN循環の重要なプロセスに関与する微生物の遺伝的基礎を提供し,長期eCO_2は各プロセスまで同調の代わりにN循環経路に選択的に影響を及ぼすことを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 微生物 ,  *草原 ,  キャラクタリゼーション ,  *生態系 ,  遺伝 ,  土壌微生物 ,  *窒素循環 ,  硝酸還元 ,  異化
準シソーラス用語： 分類学 ,  遺伝子ファミリー ,  陸上生態系 ,  生物地球化学 ,  微生物コンソーシアム ,  *メタゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 窒素循環 ,  メタゲノム再構成 ,  ショットガンメタゲノム配列決定 ,  CO_2上昇 ,  草地

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 濃縮 ,  草地 ,  生態系 ,  窒素循環 ,  経路 ,  メタゲノム ,  再構成