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J-GLOBAL ID：201702275155396773   整理番号：17A1484663

Lactobacillus casei群の株におけるプロファージプロファイルの特性化のための高速PCRに基づく方法【Powered by NICT】

A fast PCR-based method for the characterization of prophage profiles in strains of the Lactobacillus casei group

著者 (3件)： Zaburlin Delfina (Instituto de Lactologia Industrial (Universidad Nacional del Litoral, Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas), Facultad de Ingenieria Quimica, Santiago del Estero 2829, 3000 Santa Fe, Argentina) ,  Mercanti Diego J. (Instituto de Lactologia Industrial (Universidad Nacional del Litoral, Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas), Facultad de Ingenieria Quimica, Santiago del Estero 2829, 3000 Santa Fe, Argentina) ,  Quiberoni Andrea (Instituto de Lactologia Industrial (Universidad Nacional del Litoral, Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas), Facultad de Ingenieria Quimica, Santiago del Estero 2829, 3000 Santa Fe, Argentina)
資料名： Journal of Virological Methods  (Journal of Virological Methods)
巻： 248  ページ： 226-233  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0807B  ISSN： 0166-0934  CODEN： JVMEDH  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 溶原性であるcasei群(L.casei,L.paracasei及びL.rhamnosus)の乳酸桿菌属株の間で広く拡散し,プロファージは最も株特異的DNAを説明した。多くのPCRに基づく方法は乳酸菌の自由ファージを検出するために開発されたが,それらはプロファージを考慮していない。本研究では,溶原性の検出のための新しいPCR法はL.casei群の株(BL23を含む)とバクテリオファージのゲノム配列を用いて開発した。九対のプライマーは高度に保存されたプロファージiA2(対#1-#3)と温帯起源のファージ二群の断片を選択的に増幅するために設計した:C_L1/C_L2/iLp1308/iLp84(対#4と#5)とLrm1/J 1/PL-1/A2/AT3/Lc Nu(#6#9対)。caseiグループの四十九株はPCRに供した。溶菌ファージの残存物を含む株はiA2関連プロファージを含むものより多かった。対#2の組合せ,ターミナーゼの大サブユニット(TLS)に及ぼすアニーリング,および対#3,ヘリカーゼ(順方向)と非コード領域(逆)に及ぼすアニーリング,iA2のようなプロファージのための最良の診断性能を示した。残存ファージC_L1/C_L2/iLp1308/iLp84の評価のために,対#4(TLSに及ぼすアニーリング)は対#5(ポータル蛋白質)より多かった。ファージLrm1/J 1/PL-1/A2/AT3/Lc Nuの検出した対#6のプライマー,ファージゲノムの非コード領域に設計した最適;対#6は,あるプロファージ残存物の高い保存性を明らかにした。全体として,著者らのPCR法が成功裏にL.casei群の株におけるプロファージまたは残存物のグループを検出し,識別した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  サブユニット ,  乳酸菌 ,  *カゼイ菌 ,  焼なまし ,  *バクテリオファージ ,  *キャラクタリゼーション ,  タンパク質 ,  溶菌 ,  *プロファージ ,  PCR法
準シソーラス用語： 非翻訳領域 ,  ゲノム配列 ,  溶原性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： PCR ,  バクテリオファージ ,  酪農 ,  Lactobacillus ,  迅速法

分類 (3件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝子操作  (EC02050B) ,  ウイルスの形態学,分類学  (EG04020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： Lactobacillus ,  株 ,  特性化 ,  PCR