重金属ストレス下における白骨土壌のデジタル遺伝子発現プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Yuan Zhangchun; Mo Jianxin; Yuan Liujiao; Yu Rufeng; Liu Qian; Zhong Jundi; Liu Kaidong

文献

J-GLOBAL ID：201702275855691628 整理番号：17A1930797

重金属ストレス下における白骨土壌のデジタル遺伝子発現プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Digital Gene Expression Profiling Analysis of Avicennia marina under Heavy Metal Stress Treatment

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巻： 30 号： 2 ページ： 206-213 発行年： 2017年
JST資料番号： C2425A ISSN： 1001-1498 CODEN： LKYAEB 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

【目的】本研究の目的は,重金属ストレスによって処理された白い骨における遺伝子発現の変化を研究することであり,重金属汚染ストレスの機構を明らかにするために,骨質土壌における遺伝子発現の変化を研究することであった。[方法]高スループット配列決定に基づくデジタル遺伝子発現スペクトル(DGE)技術を用いて、重金属ストレス処理群と対照群の白骨土壌材料に対して、転写群の配列分析を行った。【結果】対照群と比較して,重金属処理下では,合計459の差次的発現遺伝子があり,そのうち,885の発現が増加し,1774の発現が減少したことが示された。大部分の遺伝子は重金属処理サンプル中の発現量が非常に大きく誘導され、GO機能アノテーションにより、差次的発現遺伝子は主に葉緑体及び細胞内の各種膜構造に局在することが分かった。KEGG代謝経路の分析により,「細胞代謝」,「細胞成分の組合せ,生合成」,「刺激に対する応答」などの過程に関与していることが分かったが,差次的発現遺伝子は126本のPathwaysに分布していた。「リボソーム」、「光合成作用」、「アセトアルデヒド酸塩代謝」、「ピルビン酸代謝」などの経路に関わる。また、重金属ストレスはテルペン、フラボノイド類化合物の生合成の重要な酵素遺伝子(キタニルピロールシンターゼ(0009238)、フラボノール合成酵素(0001833))の発現を促進し、さらに、白骨の有効成分の蓄積を促進する。これらの結果は,サイトカイニン加水分解酵素遺伝子CKX7(0057124)とブラシノリン脂質シグナル伝達遺伝子BSK(0043741)の発現を有意に誘導し,重金属ストレスに対する白骨の適応性を改善することを示した。さらに、転写因子分析により、bHLH、NAC、MYB-relatedとWRKYが重金属ストレスにおいて重要な役割を果たしていることが分かった。実験により、8つの環境刺激応答と密接に関連する遺伝子を選択し、qRT-PCRにより、それらの重金属汚水ストレス処理下の発現差異を検証し、結果はデジタル遺伝子発現スペクトル分析の結果と一致し、差異発現遺伝子データの有効性を実証した。[結論]重金属の処理は,大量の新陳代謝,光合成,小分子酸合成,ホルモン合成とシグナル伝達及び二次代謝産物合成関連遺伝子の発現に影響を与えた。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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