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J-GLOBAL ID：201702276243125236   整理番号：17A1565325

超高コピー167bpタンデムリピートとリボソームDNAに基づく洗練されたPanax ginseng核型【Powered by NICT】

A refined Panax ginseng karyotype based on an ultra-high copy 167-bp tandem repeat and ribosomal DNAs

著者 (9件)： Waminal Nomar Espinosa (Department of Plant Science, Plant Genomics and Breeding Institute, and Research Institute of Agriculture and Life Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Waminal Nomar Espinosa (Department of Life Science, Plant Biotechnology Institute, Sahmyook University, Seoul, Republic of Korea) ,  Choi Hong-Il (Advanced Radiation Technology Institute, Korea Atomic Energy Research Institute, Jeongeup, Republic of Korea) ,  Kim Nam-Hoon (Department of Plant Science, Plant Genomics and Breeding Institute, and Research Institute of Agriculture and Life Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Jang Woojong (Department of Plant Science, Plant Genomics and Breeding Institute, and Research Institute of Agriculture and Life Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Lee Junki (Department of Plant Science, Plant Genomics and Breeding Institute, and Research Institute of Agriculture and Life Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Park Jee Young (Department of Plant Science, Plant Genomics and Breeding Institute, and Research Institute of Agriculture and Life Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Kim Hyun Hee (Department of Life Science, Plant Biotechnology Institute, Sahmyook University, Seoul, Republic of Korea) ,  Yang Tae-Jin (Department of Plant Science, Plant Genomics and Breeding Institute, and Research Institute of Agriculture and Life Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea)
資料名： Journal of Ginseng Research  (Journal of Ginseng Research)
巻： 41  号： 4  ページ： 469-476  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3176A  ISSN： 1226-8453  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Panax ginseng Meyer(アジアオタネニンジン)は24本の染色体の半数体ゲノム当量で>3.5Gbpの大核ゲノムサイズを持っている。タンデムリピート(TR)は多くの植物におけるゲノムの重要な部分を占め,しばしば特異的ゲノム遺伝子座で見出され,識別染色体の有用な分子細胞遺伝学的ツールとなっている。P.ginsengゲノム構造を理解するために,著者らは超高コピー167bp TR(Pg167TR)を特性化し,その染色体分布と同様に染色体同定のためのその有用性を検討した。Pg167TRのポリメラーゼ連鎖反応アンプリコンは直接ニックトランスレーション法を用いて,5Sおよび45S rDNAアンプリコンと共に,標識した。直接蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)はPg167TRの染色体分布を解析した。最近,著者らはrDNAとDAPI(4′,6-ジアミジノ-2-フェニルインドール)バンドを用いたP.ginsengの24染色体対核型分析の方法を報告した。,全24P.ginseng染色体におけるPg167TRの独特な分布が観察され,個々の相同染色体の容易な同定を可能にした。さらに,5Sおよび45S rDNAプローブの直接標識は,以前に報告されていない二の更なる5S rDNA遺伝子座の同定を可能にし,P.ginseng核型の精密化を可能にした。個々のP.ginseng染色体の同定はPg167TR FISHを用いて達成した。染色体同定はP.ginsengゲノム構造を理解する上で重要であり,著者らの方法は,遺伝的連鎖地図とゲノム足場アンカリングの将来の統合のために有用であろう。さらに,P.ginsengの進化を理解するための努力における近縁種との比較研究のための良好なツールである。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *核型 ,  キャラクタリゼーション ,  染色体 ,  PCR法 ,  半数体 ,  連鎖地図 ,  プローブ ,  ゲノム ,  FISH
準シソーラス用語： 5S rDNA ,  45S rDNA ,  アンプリコン ,  ゲノム構造 ,  分子遺伝学 ,  *縦列反復配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： FISH ,  karyotype ,  Panax ginseng ,  Pg167TR ,  タンデム反復配列

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： コピー ,  タンデムリピート ,  リボソームDNA ,  Panax ,  核型