中国におけるパパイヤのtrap遺伝子の構造と遺伝的進化の分析により,中国における遺伝子型の進化を分析した。【JST・京大機械翻訳】

He Xin; Liu Junlong; Liu Aihong; Wang Jinming; Niu Qingli; Li Youquan; Yin Hong; Luo Jianxun; Guan Guiquan

文献

J-GLOBAL ID：201702276243540948 整理番号：17A1853534

中国におけるパパイヤのtrap遺伝子の構造と遺伝的進化の分析により,中国における遺伝子型の進化を分析した。【JST・京大機械翻訳】

The Structural and Phylogenetic Analysis of trap Gene in Ovine Babesia Species in China

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巻： 48 号： 7 ページ： 1332-1341 発行年： 2017年
JST資料番号： C2231A ISSN： 0366-6964 CODEN： CMHPAI 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

本研究では、中国におけるパキガイのtrap遺伝子の構造特徴を解析し、分子マーカーとして遺伝的進化分析を行い、中国のパキガイ属の分類関係を明らかにするためにデータを提供した。本研究では,公表されているバキュロウイルスのtrap遺伝子配列BLASTの2つのヒツジの全ゲノムのローカルデータベースを用いて,保存された配列の断片をテンプレートとして,PCRプライマーを設計した。中国で分離された6株のパパイヤのtrap遺伝子の全長配列をクローンし、その配列構造の特徴を分析した。配列類似性を比較し、系統発生樹を構築し、その遺伝的進化関係を分析した。【結果】3つのイントロン,3,4,および5つのイントロンを含む6つのクローンを得て,予測されたオープンリーディングフレーム(ORF)のサイズは,それぞれ,1444,2100/2,142,および28286bpであった。アミノ酸配列分析により、それらはいずれもTRAPタンパク質ファミリーの特徴的なvWFA、TSR、膜貫通ドメインとCTDドメインを有することが分かった。進化関係の分析により、中国の羊に感染したバベット虫は3つのグループに分けられ、グループ内の配列類似性は99.8%~100%で、グループ間のは43.6%~74.6%であることが示された。系統発生樹において,6つの株は,2つの枝,2つの枝,2つの小枝に分類された,そして,6つの株は2つの小枝に分類されたが,それらの蛋白質特性は構造的に保存されていることが示されたことが示されたことが示されたことが示されたことが示されたことが示されたことが示されたことが示唆されたことが示されたことが示唆されたことが示唆されたことが示唆されたことが示唆されたことが示唆されたことが示唆されたことが示唆されたことが示唆されたことが示唆された。中国において分離されたヒツジの2つの種は,2つの亜種が存在するかもしれない。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学

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