文献

J-GLOBAL ID：201702276345396153   整理番号：17A0575094

NMRおよびドッキング実験に基づいたNF-κB阻害性蛋白質p100とE3ユビキチンリガーゼβ-TrCPの相互作用モデル

Model of the Interaction between the NF-κB Inhibitory Protein p100 and the E3 Ubiquitin Ligase β-TrCP based on NMR and Docking Experiments

著者 (5件)： MELIKIAN Maxime (Univ. Paris Descartes, Paris, FRA) ,  ELUARD Baptiste (Univ. Paris Descartes, Paris, FRA) ,  BERTHO Gildas (Univ. Paris Descartes, Paris, FRA) ,  BAUD Veronique (Univ. Paris Descartes, Paris, FRA) ,  EVRARD-TODESCHI Nathalie (Univ. Paris Descartes, Paris, FRA)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 57  号： 2  ページ： 223-233  発行年： 2017年02月 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ユビキチン-プロテアソームにおけるE3ユビキチンリガーゼβ-TrCPとNF-κB阻害性蛋白質p100の相互作用メカニズムは依然として不明である。本論文では,ホスホデグロンモチーフを含有する21-merのp100ペプチド(21P-p100)を用いて,β-TrCPとp100とのNMRおよび分子ドッキング研究を実施した。さらにβ-TrCPと相互作用するp100のアミノ酸残基を特定するために飽和移動差NMR測定を行った。β-TrCP存在下での21P-p100のNMR構造計算,それら複合体のドッキングモデル,および分子動力学(MD)から,p100のpSer865,Tyr867,pSer869,およびβ-TrCPのArg474の側鎖が相互作用において重要であると強く示唆された。またHEK293細胞にβ-TrCPとp100を共トランスフェクトさせ,免疫沈降を実施し,5つのアルギニン残基が相互作用に重要であることがわかった。ドッキングモデルでβ-TrCPの重要残基の変異解析から,Arg285,Arg410,Arg431,およびArg521が複合体の安定化に必須であることを検証した。それらの結果をIκB-α結合と比較したところ,リガンド結合状態を予測し,リガンド結合におけるβ-TrCP蛋白質構造のバリエーションを考えることが出来るようになった。

シソーラス用語： *NFκB ,  *ペプチドシンターゼ ,  ユビキチン化 ,  タンパク質分解 ,  ドッキング ,  分子認識 ,  *分子動力学 ,  計算機シミュレーション ,  セリン/トレオニンキナーゼ ,  IκBタンパク質 ,  *分子間相互作用 ,  タンパク質複合体 ,  NMR【磁気共鳴】 ,  アミノ酸残基
準シソーラス用語： *E3ユビキチンリガーゼ ,  *β-TrCP ,  p100 ,  ユビキチン-プロテアソーム系 ,  分子ドッキング ,  分子動力学シミュレーション ,  IKKα ,  IκB-α ,  飽和移動差NMR

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (10件)： NMR ,  ドッキング ,  実験 ,  NF-κB ,  阻害 ,  蛋白質 ,  p100 ,  E3ユビキチンリガーゼ ,  相互作用 ,  モデル