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J-GLOBAL ID：201702276640043055   整理番号：17A1440766

転移性遺伝要素のコピー数増加と雑種起源の侵略性魚類における蛋白質コード遺伝子【Powered by NICT】

Copy number increases of transposable elements and protein-coding genes in an invasive fish of hybrid origin

著者 (8件)： Dennenmoser Stefan (Department for Evolutionary Genetics, Max-Planck Institute for Evolutionary Biology, Plon, Germany) ,  Dennenmoser Stefan (Institute for Biology, Carl von Ossietzky University Oldenburg, Oldenburg, Germany) ,  Sedlazeck Fritz J. (Department of Computer Science, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, USA) ,  Iwaszkiewicz Elzbieta (Department for Evolutionary Genetics, Max-Planck Institute for Evolutionary Biology, Plon, Germany) ,  Li Xiang-Yi (Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, University of Zurich, Zurich, Switzerland) ,  Altmueller Janine (Cologne Center for Genomics, and Institute of Human Genetics, University of Cologne, Cologne, Germany) ,  Nolte Arne W. (Department for Evolutionary Genetics, Max-Planck Institute for Evolutionary Biology, Plon, Germany) ,  Nolte Arne W. (Institute for Biology, Carl von Ossietzky University Oldenburg, Oldenburg, Germany)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 26  号： 18  ページ： 4712-4724  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 雑種起源の系統の構造遺伝的変異の進化的動力学はよく調べられていない,構造変異は,制御されたハイブリッド交雑で増加する可能性がある。構造変異体は,侵襲Cottus,最近の雑種起源親種Cottus rhenanusおよびCottus perifretum両方への魚に蓄積するかどうかを調べた。10,979遺伝子のエキソンにおけるコピー数の変動は比較ゲノムハイブリダイゼーションアレイを用いて評価した。十二遺伝子は両親と比較して侵襲Cottusで有意に高いコピー数を示した。これは,ビジョン,解毒および筋発生に関連した三の遺伝子の発現の増加と一致し,可能な遺伝子量効果を示唆した。推定トランスポゾンのコピー数増加は1,005反復要素のde novo集合に対するゲノムDNA読み取りの比較マッピングにより評価した。エキソンとは対照的に,反復要素のコピー数増加は侵襲性Cottusで一般的だった(20.7%)が,減少は極めて稀であった(0.01%)。増加した反復要素の中で,53.8%がC.rhenanusと比較してC.perifretumにおける高い数で発生したが,1.4%のみがC.rhenanusでより豊富であった。は祖先から遺伝物質を増幅するバイアス変異過程を意味している。ハイブリダイゼーションを介してde novo突然変異の頻度を評価するために,五種類の候補遺伝子座におけるコピー数の変化のための親種の間の64実験室で飼育したF_2子孫をスクリーニングした。新しい構造変異体に対する証拠を見出し,それらは著者らのサンプリングスキームを検出されることは稀すぎることが示唆された。代わりに,著者らは,制御された断面で観察されたよりもより多くの世代にわたって蓄積されなければならない。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *タンパク質 ,  交雑 ,  分子ハイブリダイゼーション ,  遺伝子量効果 ,  *遺伝子 ,  トランスポゾン ,  *遺伝 ,  *コピー数 ,  遺伝学 ,  変異 ,  バイアス
準シソーラス用語： de novo突然変異 ,  ゲノムDNA ,  比較ゲノムハイブリダイゼーション ,  遺伝的変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： アレイ比較ゲノムハイブリダイゼーション ,  カジカ ,  ディジタル液滴PCR ,  雑種の種分化 ,  侵入遺伝学 ,  構造変異

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 転移性遺伝要素 ,  コピー数 ,  雑種 ,  起源 ,  魚類 ,  蛋白質 ,  遺伝子