主な麻類作物のITS配列解析と系統進化【JST・京大機械翻訳】

Zhang Lilan; Wang Jun; Wan Xuebei; Xu Yi; Zhang Liemei; Fang Pingping; Qi Jianmin; Zhang Liwu

文献

J-GLOBAL ID：201702276847893031 整理番号：17A1783610

主な麻類作物のITS配列解析と系統進化【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Internal Transcribed Spacers (ITS) Sequences and Phylogenetics of Main Bast Fiber Crops

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資料名：
巻： 43 号： 6 ページ： 862-874 発行年： 2017年
JST資料番号： C2128A ISSN： 0496-3490 CODEN： TSHPA9 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

それらの間のITS配列を比較することによって,それらの間の系統的位置と進化的関係性を明らかにすることができた。本研究では、PCR増幅とGenBankデータベースの検索により、32種類の麻類作物と11個の配列決定作物のリボソーム体内の転写スペーサ(internal transcribed spacers、ITS)の配列を獲得した。MEGEソフトウェアを用いてITSの長さ、G+C含有量と相同性のパーセンテージの差異を分析した。結果により、ジュート属、ケナフ属、ラミー属とアマ属のITSの基本配列の全長はそれぞれ963、939、658と686bpであることが分かった。G+C含有量は,それぞれ57.87%,58.03%,59.05%および53.75%であった。黄麻属の変異領域は220~386bpの間に集中し,ケナフ属の変異領域は2つの領域(206~347bp,599~713bp)に集中していた。4つの領域(158~163 bp,193~199 bp,288~333 bp,681~688 bp)に属しているITSの変異領域があることが示されたが,それらの間には有意差があった。5つの領域(219~229 bp,235~240 bp,427~432 bp,468~484 bp,588~594 bp)において,ITSの変異領域は,5つの領域に分布していたことが示された。系統位置分析により、ケナフ属とワタの近縁関係が最も近く、ジュートとワタの近縁関係が近いことが明らかになった。アマとラミーはそれぞれ一つの小枝である。システムの位置分析は伝統的な植物分類結果と一致している。主な麻類作物の比較ゲノム学を研究する際に、ケナフ、ジュートは綿を参考にし、ラミーはポプラやひましを参考することができる。ケナフ属の進化時間は約33.7百万年前(million years ago,MYA)、ジュート属は約65.3MYA、ラミー属は約67.5MYA、アマ属は約90.5MYAであると推測された。主な麻類の進化時間が長くなるほど、異なる種間のITS変異の区域が多くなる。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

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微生物形態学・分類学 , 植物分類学

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