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J-GLOBAL ID：201702277235404636   整理番号：17A0478460

CloudPhylo 系統発生再構築のための迅速および拡張性ツール

CloudPhylo: a fast and scalable tool for phylogeny reconstruction

著者 (6件)： XU Xingjian (Beijing Inst. of Genomics (BIG), Chinese Acad. of Sci. (CAS), Beijing, CHN) ,  XU Xingjian (Univ. Chinese Acad. of Sci., Beijing, CHN) ,  JI Zhaohua (Inner Mongolia Normal Univ., Hohhot, CHN) ,  JI Zhaohua (Beijing Univ. Technol., Beijing, CHN) ,  JI Zhaohua (Inner Mongolia Xing’an Vocational and Technical Coll., Wulanhaote, CHN) ,  ZHANG Zhang (Beijing Inst. of Genomics (BIG), Chinese Acad. of Sci. (CAS), Beijing, CHN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 3  ページ： 438-440  発行年： 2017年02月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 系統発生再構築は分子進化研究に対して重要であるが,計算機利用的に困難な課題である。本報告では,系統発生再構築のための大規模データセットを処理できるSparkにおいて構築されたツール,CloudPhyloを示した。経験的データにおいて証明されたように,CloudPhyloはビッグデータ解析に適し,系統発生樹において高効率および良好な拡張性を達成した。

シソーラス用語： *系統発生 ,  *計算機利用 ,  *分子進化 ,  集合 ,  データ蓄積 ,  データ ,  経験 ,  実験 ,  系統樹 ,  スケーラビリティ【計算機】
準シソーラス用語： 大規模データセット ,  経験的データ ,  ビッグデータ ,  系統発生樹 ,  拡張性

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  計算機利用技術一般  (JE01000C)

タイトルに関連する用語 (4件)： 系統発生 ,  再構築 ,  拡張性 ,  ツール