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J-GLOBAL ID：201702277497699548   整理番号：17A1523458

トランスクリプトームによる創傷性脳損傷遺伝子発現の変化【JST・京大機械翻訳】

Changes of gene expression of traumatic brain injury based on transcriptomics

著者 (7件)： Liao Jilian (福建省第二人民医院) ,  Cheng Shixiang (300162天津,武警后勤学院附属医院脳科医院,武警部隊脳創傷与神経疾病研究所、天津市神経創傷修復重点実験室) ,  Yi Tailong (300162天津,武警后勤学院附属医院脳科医院,武警部隊脳創傷与神経疾病研究所、天津市神経創傷修復重点実験室) ,  Sun Hongtao (300162天津,武警后勤学院附属医院脳科医院,武警部隊脳創傷与神経疾病研究所、天津市神経創傷修復重点実験室) ,  Xu Zhongwei (武警后勤学院中心実験室) ,  Tu Yue (300162天津,武警后勤学院附属医院脳科医院,武警部隊脳創傷与神経疾病研究所、天津市神経創傷修復重点実験室) ,  Zhang Sai (300162天津,武警后勤学院附属医院脳科医院,武警部隊脳創傷与神経疾病研究所、天津市神経創傷修復重点実験室)
資料名： Zhonghua Shenjing Waike Zazhi  (Zhonghua Shenjing Waike Zazhi)
巻： 33  号： 1  ページ： 72-77  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2315A  ISSN： 1001-2346  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:外傷性脳損傷後の遺伝子発現変化及び脳損傷後の神経保護機序を検討する。方法:細胞損傷モデル(CICII)を用いて細胞損傷モデルを確立し、各項目のパラメータをそれぞれ以下のように設定した。パルスの時間は50msで,測定圧力は0.165MPaであり,気体パルスの圧力は(0.021±0.001)MPaであった。Trizol法を用いて損傷群と対照群の細胞RNAを抽出し、mRNAのシークエンシングを行い、差異発現遺伝子に対して遺伝子オントロジー分析と生物情報分析ソフト(IPA)を用いて信号経路分析を行った。リアルタイム蛍光定量PCR(qPCR)により定量結果を検証した。結果:2つのサンプルにおいて、それぞれ1431万個と1,551万個の読み取りが得られ、15018個の遺伝子が2つのサンプルに発現されていることが同定された。差次的発現遺伝子は1424個で,対照群と比較して,損傷群では1198個の遺伝子が上方制御され,226個の遺伝子が下方制御された(P<0.01)。対照群と比較して,低酸素誘導因子1α抗体(HIF-1α)とZFP36発現は下方制御された,そして,HIF-1αとZFP36を中心とする調節ネットワークが構成された。このネットワークにおいて、HIF-1αはEGLN2とZFP36によって調節され、PER1と相互作用し、同時に多数の下流遺伝子の発現を調節し、例えばH2AX、ABCF2とSLC39A7である。【結論】脳損傷12時間後に,HIF-1αmRNAレベルは,ZFP36,HNRNPDおよびEGLN2により下方制御され,H2FXの発現をさらに調節し,神経細胞アポトーシスを阻害し,神経細胞の損傷を促進する。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子発現 ,  抗体 ,  ネットワーク ,  ニューロン ,  *トランスクリプトーム ,  相互作用 ,  アップレギュレーション ,  *遺伝子 ,  定量的PCR法 ,  *脳損傷 ,  ダウンレギュレーション ,  mRNA
準シソーラス用語： 低酸素誘導性因子1αサブユニット ,  遺伝子オントロジー ,  細胞障害 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Craniocerebral trauma ,  Transcriptome ,  Gene expression ,  RNA sequence ,  Hypoxia inducible factor-1α

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： トランスクリプトーム ,  創傷 ,  脳損傷 ,  遺伝子発現