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J-GLOBAL ID：201702277659923103   整理番号：17A0842743

RNAの二次構造アライメントアルゴリズムの包括的研究

A comprehensive study of RNA secondary structure alignment algorithms

著者 (2件)： CHIU Jimmy Ka Ho (La Trobe Univ.) ,  CHEN Yi-Ping Phoebe (La Trobe Univ.)
資料名： Briefings in Bioinformatics  (Briefings in Bioinformatics)
巻： 18  号： 2  ページ： 291-305  発行年： 2017年03月 
JST資料番号： W2342A  ISSN： 1467-5463  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 14種類の既存のRNA二次構造アライメント法を,アライメント問題への対処およびアライメントの最適性に基づいて分類するとともに,RNA二次構造アライメント法をアルゴリズム的に示した。また,RNA二次構造アライメント法を,塩基対編集操作のサポート,時間計算量に関して比較した。その結果,RNA二次構造アライメントアルゴリズムの中心概念が明らかになった。本研究で得られた技術的詳細および比較は,最適なRNA二次構造比較ツールの作製や新しい二次構造アライメントアルゴリズムのデザインにおける参照として利用できることが示された。

シソーラス用語： 二次構造 ,  *RNA【核酸】 ,  *アラインメント ,  *アルゴリズム ,  編集 ,  分類 ,  ループ構造 ,  塩基対 ,  計算量
準シソーラス用語： *RNA二次構造 ,  *シュードノット ,  ステムループ構造 ,  時間計算量

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： RNA ,  二次構造 ,  アライメント ,  アルゴリズム ,  研究