文献

J-GLOBAL ID：201702278125467375   整理番号：17A1099831

核トランスクリプトームにおけるゼブラフィッシュは遺伝子調節論理符号化における特異的細胞集団のBiotagging【Powered by NICT】

Biotagging of Specific Cell Populations in Zebrafish Reveals Gene Regulatory Logic Encoded in the Nuclear Transcriptome

著者 (8件)： Trinh Le A. (Molecular and Computational Biology, University of Southern California, Los Angeles, CA 90089, USA) ,  Chong-Morrison Vanessa (Radcliffe Department of Medicine, Weatherall Institute of Molecular Medicine, University of Oxford, Oxford OX3 9DS, UK) ,  Gavriouchkina Daria (Radcliffe Department of Medicine, Weatherall Institute of Molecular Medicine, University of Oxford, Oxford OX3 9DS, UK) ,  Hochgreb-Haegele Tatiana (Radcliffe Department of Medicine, Weatherall Institute of Molecular Medicine, University of Oxford, Oxford OX3 9DS, UK) ,  Hochgreb-Haegele Tatiana (Division of Biology and Biological Engineering, California Institute of Technology, Pasadena, CA 91125, USA) ,  Senanayake Upeka (Radcliffe Department of Medicine, Weatherall Institute of Molecular Medicine, University of Oxford, Oxford OX3 9DS, UK) ,  Fraser Scott E. (Molecular and Computational Biology, University of Southern California, Los Angeles, CA 90089, USA) ,  Sauka-Spengler Tatjana (Radcliffe Department of Medicine, Weatherall Institute of Molecular Medicine, University of Oxford, Oxford OX3 9DS, UK)
資料名： Cell Reports  (Cell Reports)
巻： 19  号： 2  ページ： 425-440  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3124A  ISSN： 2211-1247  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 複雑な生物における遺伝子調節回路の研究は個々の細胞型の選択と標的蛋白質の生化学的プロファイリングのためのロバストな方法のための正確なツールを必要とする。ビオチニレート標的蛋白質に遺伝的にコードされた成分を利用し,それらの分子間相互作用の詳細なゲノムワイド分析を可能にすることをbiotaggingと呼ばれるゼブラフィッシュにおいて汎用性があり,組織特異的二元in vivoビオチニル化システムを開発した。組織特異的運転者と細胞コンパートメント特異的エフェクター系統を用いて,我々は,生化学的,細胞的,および転写レベルでbiotaggingツールキットの特異性を実証した。biotaggingを使って異なる細胞コンパートメント(リボソームと核)における移動性の神経冠と心筋細胞のin vivoでの転写景観を特性化した。これらの分析は,コード化および非コード化RNAとcis-調節モジュールの包括的ネットワークを明らかにする,組織特異的同一性は核トランスクリプトームに埋め込まれていることを示した。複雑な胚環境に固有のバックグラウンドを除去することにより,biotaggingを高分解能での分子相互作用の解析を可能にした。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *符号化 ,  心筋細胞 ,  *トランスクリプトーム ,  リボソーム ,  ロバスト性 ,  キャラクタリゼーション ,  ビオチニル化 ,  *ゼブラフィッシュ ,  *遺伝子 ,  RNA【核酸】 ,  生化学 ,  *遺伝的調節 ,  分子間相互作用 ,  ネットワーク
準シソーラス用語： 標的蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： in vivoビオチニル化 ,  核トランスクリプトーム ,  神経冠 ,  myocardium ,  エンハンサー ,  cis regulation ,  双方向転写

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  数値計算  (JE02000J)

タイトルに関連する用語 (7件)： 核 ,  トランスクリプトーム ,  ゼブラフィッシュ ,  遺伝子調節 ,  論理 ,  符号化 ,  細胞集団