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J-GLOBAL ID：201702278508472527   整理番号：17A1384725

Eucalyptus grandisの共発現ネットワークを用いたPEG誘導性水分ストレス応答転写物の同定【Powered by NICT】

Identification of PEG-induced water stress responsive transcripts using co-expression network in Eucalyptus grandis

著者 (2件)： Ghosh Dasgupta Modhumita (Institute of Forest Genetics and Tree Breeding, R.S. Puram, Coimbatore 641002, Tamil Nadu, India) ,  Dharanishanthi Veeramuthu (Institute of Forest Genetics and Tree Breeding, R.S. Puram, Coimbatore 641002, Tamil Nadu, India)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 627  ページ： 393-407  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ユーカリの生態生理学的研究は,水が幹成長を制限する主要な因子であることを示した。生理的および生化学的パラメータに対する水分欠乏条件の影響は,Eucalyptus中に広く報告されている。本研究は遺伝子共発現ネットワークを用いたEucalyptus grandis(ユーカリ属)における主要なポリエチレングリコール誘導水分ストレス応答性転写物を同定するために実施した。3359水ストレス応答遺伝子を代表するカスタマイズされたアレイはPEG処理の0.225MPaに曝されたE.grandis(ゼラニウム)の挿木の葉におけるそれらの発現を記録するように設計した。差次的に発現した転写産物を記録し,ネットワークの構築のために用いた有意に共発現転写物。共発現ネットワークは2~45度の915ノードと三千四百五十四の縁を用いて構築した。九十四GOカテゴリーと117の機能的経路は,ネットワークで同定された。479ノードと1005エッジを持つMCODE解析発生27モジュールとモジュール6は生物学的に関連するネットワークとして同定した。モジュールで代表される主要な水応答性転写物は,デヒドリン,オスモチン,LEA蛋白質,エクスパンシン,アラビノガラクタン,熱ショック蛋白質,主要促進因子蛋白質,ARM反復蛋白質,ラフィノースシンターゼ,液胞膜内在性蛋白質と転写因子のようなDREB2A,ARF9,AGL24,UNE12,WLIM1とMYB66,MYB70,MYB55,MYB16とMYB103を含んでいた。本研究で開発した遺伝子発現パターンと共発現ネットワークの配位解析は,E.grandisのPEG誘導水ストレス応答を調節する可能性がある転写物の配列を同定した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *水分ストレス ,  熱ショックタンパク質 ,  転写因子 ,  ユーカリ ,  プロモーター領域 ,  *ネットワーク ,  タンパク質 ,  ポリエチレンオキシド
準シソーラス用語： *ストレス応答 ,  LEA蛋白質 ,  デヒドリン ,  転写産物 ,  ストレス応答遺伝子 ,  *共発現 ,  *Eucalyptus grandis , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 共発現ネットワーク ,  Eucalyptus ,  水分ストレス ,  Regulation ,  ハブ転写物 ,  ポリエチレングリコール

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： Eucalyptus ,  共発現 ,  PEG ,  水分ストレス ,  応答 ,  転写 ,  同定