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J-GLOBAL ID：201702278759659950   整理番号：17A1118190

海洋ガンマプロテオバクテリアにおける横方向に獲得したペクチン分解経路の水生適応【Powered by NICT】

Aquatic adaptation of a laterally acquired pectin degradation pathway in marine gammaproteobacteria

著者 (18件)： Hehemann Jan-Hendrik (MARUM, Center for Marine Environmental Sciences at the University of Bremen, Leobener Strasse, Bremen, D-28359, Germany) ,  Hehemann Jan-Hendrik (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, D-28359, Germany) ,  Truong Le Van (Institute of Marine Biotechnology, W.-Rathenau-Str. 49a, Greifswald, D-17489, Germany) ,  Truong Le Van (Institute of Biotechnology, Vietnamese Academy of Science and Technology, 18 Hoang Quoc Viet, Hanoi, Vietnam) ,  Unfried Frank (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, D-28359, Germany) ,  Unfried Frank (Institute of Marine Biotechnology, W.-Rathenau-Str. 49a, Greifswald, D-17489, Germany) ,  Unfried Frank (Pharmaceutical Biotechnology, Institute of Pharmacy, Ernst-Moritz-Arndt-University, Felix-Hausdorff-Str. 3, Greifswald, D-17487, Germany) ,  Welsch Norma (Pharmaceutical Biotechnology, Institute of Pharmacy, Ernst-Moritz-Arndt-University, Felix-Hausdorff-Str. 3, Greifswald, D-17487, Germany) ,  Kabisch Johannes (Pharmaceutical Biotechnology, Institute of Pharmacy, Ernst-Moritz-Arndt-University, Felix-Hausdorff-Str. 3, Greifswald, D-17487, Germany) ,  Kabisch Johannes (Department of Biology, Computer-aided Synthetic Biology, Technische Universitaet Darmstadt, Schnittspahnstr. 10, Darmstadt, D-64287, Germany) ,  Heiden Stefan E. (Pharmaceutical Biotechnology, Institute of Pharmacy, Ernst-Moritz-Arndt-University, Felix-Hausdorff-Str. 3, Greifswald, D-17487, Germany) ,  Junker Sabryna (Institute of Microbiology, Ernst-Moritz-Arndt-University, Friedrich-Ludwig-Jahn-Str. 15, Greifswald, D-17487, Germany) ,  Becher Dorte (Institute of Microbiology, Ernst-Moritz-Arndt-University, Friedrich-Ludwig-Jahn-Str. 15, Greifswald, D-17487, Germany) ,  Thuermer Andrea (Gottingen Genomics Laboratory (G2L), Institute of Microbiology and Genetics, University of Gottingen, Grisebachstr. 8, Gottingen, D-37077, Germany) ,  Daniel Rolf (Gottingen Genomics Laboratory (G2L), Institute of Microbiology and Genetics, University of Gottingen, Grisebachstr. 8, Gottingen, D-37077, Germany) ,  Amann Rudolf (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, D-28359, Germany) ,  Schweder Thomas (Institute of Marine Biotechnology, W.-Rathenau-Str. 49a, Greifswald, D-17489, Germany) ,  Schweder Thomas (Pharmaceutical Biotechnology, Institute of Pharmacy, Ernst-Moritz-Arndt-University, Felix-Hausdorff-Str. 3, Greifswald, D-17487, Germany)
資料名： Environmental Microbiology  (Environmental Microbiology)
巻： 19  号： 6  ページ： 2320-2333  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2561A  ISSN： 1462-2912  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 移動ゲノムアイランドは微生物と生息場所との間における機能的特性の分布は,どのように蛋白質は新しい環境への適応は不明のままである。ここで著者らは,比較系統ゲノムおよびプロテオミクスアプローチを用いた海洋細菌Pseudoalteromonas haloplanktis ANT/505はペクチン異化のための機能的経路とゲノムアイランドを獲得したことを示した。バイオインフォマティクスおよび生化学的実験は,この経路は二モジュールペクチン酸リアーゼ,PeIAとPelBを含む炭水化物活性酵素をコードすることを明らかにした。PeIAは多糖類リアーゼファミリー1(PL1)ドメインと炭水化物エステラーゼファミリー8ドメインと大きな酵素であり,PelBはPL1ドメイン及びファミリー13の二炭水化物結合ドメインを含んでいた。比較系統ゲノム解析は,経路は陸生微生物から得られたと思われた,海洋細菌でのみモジュールオルソログを観測されたことを示した。プロテオミック実験は,P.haloplanktis ANT/505はペクチンの存在下で環境へのペクチン酸リアーゼを分泌することを示した。これらモジュール酵素は,ペクチン拡散による基質と酵素の損失を低減するとの物理的相互作用を増強することを海洋革新を代表するかもしれない。著者らの結果は,海洋細菌はペクチンを異化,水生環境中の高分子基板の微生物消費を促進するかもしれない潜在的適応として酵素融合を強調できることを明らかにした。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 結合部位 ,  タンパク質 ,  *海洋 ,  異化 ,  酵素 ,  ゲノム ,  微生物 ,  *ペクチン ,  基質 ,  生息場所
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  ペクチン酸リアーゼ ,  バイオインフォマティクス ,  海洋細菌 ,  ゲノムアイランド , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (7件)： 海洋 ,  ガンマプロテオバクテリア ,  横方向 ,  獲得 ,  ペクチン ,  分解経路 ,  適応