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J-GLOBAL ID：201702279014887335   整理番号：17A1714891

ディジタル発現プロファイリングを用いたポリ(I:C)チャレンジ後のナメクジウオのえらにおける遺伝子発現の変化【Powered by NICT】

Exploring gene expression changes in the amphioxus gill after poly(I:C) challenge using digital expression profiling

著者 (8件)： Zhang Qi-Lin (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Science, Nanjing University, Nanjing, 210023 China) ,  Qiu Han-Yue (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Science, Nanjing University, Nanjing, 210023 China) ,  Liang Ming-Zhong (Department of Marine Science, Qinzhou University, Qinzhou, 535000 China) ,  Luo Bang (Guangxi Academy of Fishery Sciences, Nanning, 530000 China) ,  Wang Xiu-Qiang (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Science, Nanjing University, Nanjing, 210023 China) ,  Wang Xiu-Qiang (LPS, Nanjing Institute of Geology and Paleontology, CAS, Nanjing, 210008 China) ,  Chen Jun-Yuan (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Science, Nanjing University, Nanjing, 210023 China) ,  Chen Jun-Yuan (LPS, Nanjing Institute of Geology and Paleontology, CAS, Nanjing, 210008 China)
資料名： Fish & Shellfish Immunology  (Fish & Shellfish Immunology)
巻： 70  ページ： 57-65  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1617A  ISSN： 1050-4648  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 頭索動物,ナメクジウオは脊椎動物免疫の進化を研究するための重要なモデル動物である。最近の研究は,マイクロRNA(miRNA)発現プロファイルは免疫刺激後のナメクジウオ鰓で有意に変化することを明らかにしたが,遺伝子発現は免疫ストレスにどのように応答するかはほとんど明らかではない。ナメクジウオのえらにおける遺伝子発現変化を解明する脊椎動物における鰓免疫の進化のより深い理解を提供するであろう。ここでは,ハイスループットRNA配列決定技術(RNA-seq)を用いて制御Branchiostoma belcheriのえらとウイルス模倣体に曝露された人々のタグ基盤デジタル遺伝子発現プロファイリング(DGE)分析,ポリ(I:C)(pIC)を行った。六ライブラリーを基当たり三生物学的複製を含む対照と処理グループのために作成した。全千九百九十九の異なる発現遺伝子(DEGs)が得られ,571および1428DEG処理群では,それぞれ,アップまたはダウンレギュレーションを示した。遺伝子オントロジー(GO)用語と経路の濃縮分析は,DEGした免疫と防御応答,アポトーシス,ヒト疾患,癌,蛋白質代謝,酵素活性,及び調節的過程と主に関係することを明らかにした。添加では,八DEGを無作為にリアルタイム定量的PCR(qRT PCR)を用いたRNA-seqデータを検証するために選択し,結果は,RNA-seqアプローチの精度を確認した。次に,異なる時点より詳細で発現レベルの動的変化を調べるために八つの重要な応答遺伝子をスクリーニングした。結果はTRADD,MARCH,RNF31,NF κb,CYP450,TNFRSF6B,IFIとLECT1の発現はpICに対する抗ウイルス応答に関与する誘導されたことを示した。本研究では,抗ウイルス免疫におけるナメクジウオのえらと脊椎動物における鰓免疫の進化の役割の理解のための貴重な資源を提供する。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  酵素活性度 ,  アポトーシス ,  RNA【核酸】 ,  脊椎動物 ,  ウイルス ,  ダウンレギュレーション ,  *遺伝子発現
準シソーラス用語： RNA-seq ,  定量的リアルタイムPCR法 ,  遺伝子発現プロファイリング ,  マイクロRNA ,  動物モデル ,  *ナメクジウオ ,  *プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Branchiostoma belcheri ,  ディジタル遺伝子発現 ,  えら ,  ポリ(I:C)

分類 (1件)： 免疫反応一般  (ED03010T)

タイトルに関連する用語 (6件)： ディジタル ,  発現 ,  プロファイリング ,  ナメクジウオ ,  えら ,  遺伝子発現