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J-GLOBAL ID：201702279234550906   整理番号：17A1681480

広州地区におけるヒトサイトメガロウイルスの臨床低ウイルス株UL136遺伝子B細胞エピトープの多パラメータ予測分析【JST・京大機械翻訳】

Multi parameter prediction of B cell epitopes of UL136 gene of human cytomegalovirus clinical isolates in Guangzhou area

著者 (9件)： Yan Cuifang (510180,广州市婦女儿童医療中心 儿童神経康復科) ,  Hu Jingjing (广東省婦幼保健院儿科, 广州,511442) ,  Wu Yuanbin (广東省婦幼保健院儿科, 广州,511442) ,  Guo Mengjie (广東省婦幼保健院儿科, 广州,511442) ,  Pan Liwen (510180,广州市婦女儿童医療中心 儿童神経康復科) ,  Su Haihao (广東省婦幼保健院儿科, 广州,511442) ,  Dai Jin (510180,广州市婦女儿童医療中心 儿童神経康復科) ,  Tan Qiqi (广東省婦幼保健院儿科, 广州,511442) ,  Wang Bo (广東省婦幼保健院儿科, 广州,511442)
資料名： Zhonghua Linchuang Yishi Zazhi (Dianzi Ban)  (Zhonghua Linchuang Yishi Zazhi (Dianzi Ban))
巻： 11  号： 7  ページ： 1130-1134  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3970A  ISSN： 1674-0785  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】広州地域におけるヒトサイトメガロウイルス(HCMV)の臨床的低ウイルス株UL136遺伝子のB細胞エピトープを予測する。【方法】改良型自己最適化予測構造(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson(GOR),人工神経回路網予測(HNN)を用いて,二次構造を予測した。隠れMarkovモデル(TMHMM)を用いて,膜貫通構造を予測した。Hopp&Woods親水性方案、Emini可変性案、Jameson-Wolf抗原性方案などのパラメータを用いて、UL136遺伝子B細胞エピトープを総合的に予測した。結果:HCMV UL136アミノ酸は240のアミノ酸残基を含み,相対分子量は約27.3kD,等電点は8.26,TMHMMはUL136に膜貫通領域が存在し,65~87aaの領域を示した。細胞外領域は88~240aaの範囲であった。多パラメータ予測は以下のことを示した。親水性は,18~29,46~61,94~100,110~144,152~169,171~186,190~202,229~236aaの範囲にあった。表面性は,19~26,49~61,89~97,110~127,161~167,173~182,196~202,229~234aaの範囲にあった。極性は,18~29,31~36,51~59,94~102,111~130,155~168,178~182aaの範囲にあった。柔軟性は,18~28,46~60,115~142,148~156,160~205,226~236aaの範囲にあった。抗原性は,4~9,16~32,45~62,92~101,106~144,150~157,160~206,228~240aaの範囲にあった。二次構造予測は以下のことを示した。α-ヘリックスが主であった。不規則なロールとβ-ターンは,主に5~10,45~61,108~113,129~139,163~182,187~192,195~202,229~234aaの範囲にあり,ABCpredサーバーの包括的分析によって示された。45~60、194~209、6~21、186~201、116~131、54~69、151~166、122~137、223~238aaの区域の得点は比較的に高かった。抗原指数(AI)を予測した。115~130,196~204,163~182,229~234aaの領域において,AIはより高かったが,それらの間には,より高い相関があった。【結論】HCMV UL136遺伝子のB細胞エピトープは,115~130,196~202,229~234aaの領域にあり,そして,UL136B細胞エピトープはHCMVの治療のための実験的基礎を提供する。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 親水性 ,  免疫原性 ,  *予測 ,  抗原 ,  *ヒトサイトメガロウイルス ,  *ウイルス ,  *パラメータ推定 ,  ニューラルネットワーク ,  柔軟性 ,  等電点 ,  *遺伝子 ,  二次構造 ,  分子量 ,  アミノ酸残基
準シソーラス用語： *B細胞エピトープ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Human cytomegalovirus ,  Biological information science ,  UL136 ,  B-cell epitope

分類 (2件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (10件)： 広州 ,  地区 ,  ヒトサイトメガロウイルス ,  臨床 ,  ウイルス ,  株 ,  遺伝子 ,  B細胞エピトープ ,  パラメータ予測 ,  分析