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J-GLOBAL ID：201702280122311258   整理番号：17A1178534

アンダマン海におけるベンガル湾と火山Barren島の深海堆積物における複雑な細菌群集【Powered by NICT】

Complex bacterial communities in the deep-sea sediments of the Bay of Bengal and volcanic Barren Island in the Andaman Sea

著者 (7件)： Verma Pankaj (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, ESSO-National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Chennai, Tamil Nadu, India) ,  Raghavan Rangamaran Vijaya (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, ESSO-National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Chennai, Tamil Nadu, India) ,  Jeon Che Ok (Department of Life Science & Bio-Integration Research Center for Nutra-Pharmaceutical Epigenetics, Chung-Ang University, Seoul 06974, Republic of Korea) ,  Lee Hyo Jung (Department of Life Science & Bio-Integration Research Center for Nutra-Pharmaceutical Epigenetics, Chung-Ang University, Seoul 06974, Republic of Korea) ,  Priya Padmanaban Vishnu (Centre for Biotechnology, Anna University, Chennai, Tamil Nadu, India) ,  Dharani Gopal (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, ESSO-National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Chennai, Tamil Nadu, India) ,  Kirubagaran Ramalingam (Marine Biotechnology Division, Ocean Science and Technology for Islands Group, ESSO-National Institute of Ocean Technology, Ministry of Earth Sciences (MoES), Government of India, Chennai, Tamil Nadu, India)
資料名： Marine Genomics  (Marine Genomics)
巻： 31  ページ： 33-41  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3299A  ISSN： 1874-7787  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 深海環境は有用な微生物の潜在的源としてのグローバル注目を集め,存在する微生物の多様性とゲノムの可能性のより良い理解が必要である。この目的のために,ここでは,アンダマン海におけるベンガルと地理的に異なる火山Barren島の南西湾からの深海堆積物試料における細菌群集の組成への最初の洞察を提供した。堆積物のハイスループット16S rRNA遺伝子配列決定法が試料のそれぞれで>44,000操作的分類単位(OTUs)の存在を明らかにし,高い細菌多様性を示唆した。Actinobacteriaが最も支配的な門,分類学的帰属OTUの>20%を説明し,次いで,Firmicutes,Proteobacteria,Chloroflexiを示した。硫黄サイクルに関与する可能性があることを多数の細菌がBarren島堆積物試料で観察されたが,臨床的および工業的可能性を持つ細菌は南西部ベンガル湾からの試料で観察された。生物的および非生物的パラメータの相関分析は,サンプリング地点間の細菌の豊富さと群集組成の差異は主に堆積物テクスチャに依存することを示した。予測機能的メタゲノム手法を用いて,本研究は,これらの極端な深海環境における生存のための細菌群集を堆積物に適応可能な利点を提供する可能性がある遺伝的変異を検討した。本研究からの結果は,深海における生物資源調査と地球化学的循環に焦点を当てた将来の研究を支援するだろう。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *深海堆積物 ,  ゲノム ,  *ベンガル湾 ,  *深海 ,  *堆積物 ,  *細菌 ,  rRNA遺伝子
準シソーラス用語： メタゲノム ,  群集構造 ,  プロテオバクテリア ,  細菌多様性 ,  遺伝子配列 ,  16S rRNA ,  *細菌群集 ,  *アンダマン海 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 深海環境 ,  16S rRNA遺伝子 ,  DGGE ,  Illumina ,  アンプリコン配列決定 ,  細菌多様性

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  土壌生物  (FB04050N)

タイトルに関連する用語 (5件)： アンダマン海 ,  ベンガル湾 ,  火山 ,  深海堆積物 ,  細菌群集