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J-GLOBAL ID：201702280242784539   整理番号：17A1972056

全ゲノム配列解析:密接に関連したリステリア菌株の間の基礎となる遺伝子型の違いを同定する改良技術【Powered by NICT】

Whole genome sequence analysis; an improved technology that identifies underlying genotypic differences between closely related Listeria monocytogenes strains

著者 (7件)： Fox Edward M. (CSIRO Agriculture and Food, Victoria, Australia) ,  Casey Aidan (Teagasc Food Research Centre, Moorepark, Fermoy, Co. Cork, Ireland) ,  Casey Aidan (Department of Biological Sciences, Cork Institute of Technology, Bishopstown, Cork, Ireland) ,  Jordan Kieran (Teagasc Food Research Centre, Moorepark, Fermoy, Co. Cork, Ireland) ,  Coffey Aidan (Department of Biological Sciences, Cork Institute of Technology, Bishopstown, Cork, Ireland) ,  Gahan Cormac G.M. (School of Microbiology, University College Cork, Cork, Ireland) ,  McAuliffe Olivia (Teagasc Food Research Centre, Moorepark, Fermoy, Co. Cork, Ireland)
資料名： Innovative Food Science and Emerging Technologies  (Innovative Food Science and Emerging Technologies)
巻： 44  ページ： 89-96  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3212A  ISSN： 1466-8564  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 全ゲノムシークエンシング(WGS)の新技術は非常に使用されているパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)よりも分化株におけるより強力な識別力を有することが示されているとして,現在疾患発生調査のためのWGSにPFGEを用いたからの遷移。したがって,PFGE及びWGSの両方を用いた細菌分離株の比較が必要である。本研究では,地理的に多様な源分離の二対L.monocytogenes株が区別できないまたは密接に関連したPFGEプロファイルを持つ,WGS分析に供した。それらゲノムの比較解析は,実際に密接に関連したPFGEプロファイルを持つ株の1対は抗生物質及び重金属ストレス耐性決定因子の,可動遺伝要素における互いに有意に異なることを示した。そこで本研究では,関連株とWGS分析はサブタイピングのL.monocytogenes単離菌に利用できる最も効果的なツールであることを非常に密接に分化するWGS分析の能力を示した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *遺伝子型 ,  単離 ,  地理学 ,  分化 ,  *ゲノム ,  転移性遺伝要素 ,  細菌 ,  パルスフィールドゲル電気泳動 ,  抗生物質 ,  重金属 ,  *リステリア菌
準シソーラス用語： 決定因子 ,  ストレス耐性 ,  分離株 ,  *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 全ゲノム配列解析 ,  PFGE ,  Listeria monocytogenes

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： ゲノム ,  配列解析 ,  リステリア ,  菌株 ,  基礎 ,  遺伝子型 ,  同定