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J-GLOBAL ID：201702280405393689   整理番号：17A1548975

ベチベルソウ(Chrysopogon zizanioides)の完全な葉緑体ゲノム配列決定は他系統からの非稔性「サンシャイン」品種を区別するマーカーを同定する【Powered by NICT】

Complete chloroplast genome sequencing of vetiver grass (Chrysopogon zizanioides) identifies markers that distinguish the non-fertile ‘Sunshine’ cultivar from other accessions

著者 (4件)： Sigmon Brandi A. (Department of Agronomy and Horticulture, University of Nebraska-Lincoln, Lincoln, NE, 68583, USA) ,  Adams Robert P. (Biology Department, Baylor University, Waco, TX, 76798, USA) ,  Mower Jeffrey P. (Department of Agronomy and Horticulture, University of Nebraska-Lincoln, Lincoln, NE, 68583, USA) ,  Mower Jeffrey P. (Center for Plant Science Innovation, University of Nebraska-Lincoln, Lincoln, NE, 68588, USA)
資料名： Industrial Crops and Products  (Industrial Crops and Products)
巻： 108  ページ： 629-635  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0732A  ISSN： 0926-6690  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ベチベルソウ(Chrysopogon zizanioides(L.)Roberty)の非親物質系統は環境修復と侵食制御のための世界の多くの地域で利用されてきたが,稔性植物は有害雑草となりうる。無菌ベチバーの環境的利益を世界的な関心のために,ユニークな多型は稔性植物から非受精を区別するために必要である。本研究では,三非受精および二名の多産vetiversの葉緑体(cp)ゲノムの配列を決定した。サイズ,構造およびベチバーcpゲノムの含量はAndropogoneae内の他のイネ科植物の典型であった。しかし,0.02%の総cp多型率は5~7倍低かった,最近の発散または他のイネ科植物と比較して非受精および稔性vetiversにおける進化の遅い速度を示唆した。全部で28の多型 14の一塩基多型(SNP),11マイクロサテライト,二の小indels,microinversionを含む は稔性系統からの不稔サンシャインを識別したことを同定した。イネ科cpゲノムの広範な調査では,SNPの一つはサンシャインゲノムを一意に特定する開裂増幅多型配列(CAPS)アッセイを開発した。26稔性および不稔性vetiversのパネルにおいて,四サンシャインと六つの付加的非受精vetiversは全てのほかの系統種とは区別された。二他の不稔系統を本分析によって検出されなかった,不稔はベチバーへの1回以上始まったことを示唆した。cpゲノム配列におけるこれらの変化は,配列決定または新しく開発したCAPSアッセイを使った他の系統における不稔性を評価するのに利用できる。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *品種 ,  防腐処理 ,  イネ科 ,  環境修復 ,  パネル ,  受精 ,  一塩基多型 ,  *葉緑体 ,  *稔性 ,  不稔 ,  雑草 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： *ゲノム配列 ,  増幅切断多型配列 ,  葉緑体ゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ベチバ草 ,  Chrysopogon zizanioides ,  サンシャイン ,  葉緑体マーカー ,  色素体ゲノム

分類 (2件)： 油料作物  (FC03074V) ,  発生,成長,分化  (EH02030U)

タイトルに関連する用語 (7件)： Chrysopogon ,  葉緑体ゲノム ,  系統 ,  稔性 ,  品種 ,  マーカー ,  同定