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J-GLOBAL ID：201702280583566246   整理番号：17A1161586

エピソード遺伝子流動で連結された2樹種における適応進化と分離負荷発散のゲノム景観に寄与する【Powered by NICT】

Adaptive evolution and segregating load contribute to the genomic landscape of divergence in two tree species connected by episodic gene flow

著者 (9件)： Christe Camille (Department of Biology, University of Fribourg, Chemin du Musee 10, CH-1700, Fribourg, Switzerland) ,  Stolting Kai N. (Department of Biology, University of Fribourg, Chemin du Musee 10, CH-1700, Fribourg, Switzerland) ,  Paris Margot (Department of Biology, University of Fribourg, Chemin du Musee 10, CH-1700, Fribourg, Switzerland) ,  Fraиsse Christelle (Institut des Sciences de l’Evolution (UMR 5554), CNRS-UM2-IRD, Place Eugene Bataillon, F-34095, Montpellier, France) ,  Fraиsse Christelle (Station Mediterraneenne de l’Environnement Littoral, Universite Montpellier 2, 2 Rue des Chantiers, F-34200, Sete, France) ,  Bierne Nicolas (Institut des Sciences de l’Evolution (UMR 5554), CNRS-UM2-IRD, Place Eugene Bataillon, F-34095, Montpellier, France) ,  Bierne Nicolas (Station Mediterraneenne de l’Environnement Littoral, Universite Montpellier 2, 2 Rue des Chantiers, F-34200, Sete, France) ,  Lexer Christian (Department of Biology, University of Fribourg, Chemin du Musee 10, CH-1700, Fribourg, Switzerland) ,  Lexer Christian (Department of Botany and Biodiversity Research, University of Vienna, Rennweg 14, A-1030, Vienna, Austria)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 26  号： 1  ページ： 59-76  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生殖隔離(RI)が完了する前にスペシエーションはしばしば多岐にわたる集団間の遺伝的接触の繰り返しを含んでいる。全ゲノムシークエンシング(WGS)はスペシエーションのゲノム的基盤を解明するための大きな可能性を秘めている。モデルツリーの属Populus(ポプラ,アスペン,ハコヤナギ),Populus albaとP.tremulaの二生態的多様性,交雑種,人口プールのWGSから>八百六十万の一塩基多型(SNP)を用いて調べた。(i)上昇と減少した相違の領域のためのこれらの種のゲノムを走査し,(ii)全ゲノム部位周波数スペクトル(SFS)に基づいて関節個体群統計学的歴史の重要な側面を評価し,(iii)の分岐に関するゲノム全体像形成における適応と有害な符号化変異の潜在的役割を推定するためのゲノムデータを使用した。高全ゲノム分化にもかかわらず固定多型なしに多数の小さな,不揃いに分布したゲノム領域を同定した。関節SFSは,古代および反復遺伝子流動によって最も良く説明し,精密照準候補種間移動管を可能にした。選択(DoS)の方向は推定移動管における遺伝子とゲノムの残りの間で異なっていた,適応放散の潜在的役割を示し,RIの進化と破壊に及ぼす有害な突然変異を分離する。発散の間に正の選択の影響を受ける遺伝子はいくつかの機能的に興味ある基が豊富で,植物の先天性免疫に関与するよく知られた候補「スペシエーション遺伝子を含んでいた。著者らの結果は,適応放散は主に固有と人口学的な過程を通してこれらの交雑種におけるRIに影響することを示唆する。ゲノムの統合分子データと種分化に特に遺伝的経路の効果を明らかにするために非常に有望である。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： スペシエーション ,  分化 ,  生態 ,  *遺伝子 ,  *遺伝 ,  一塩基多型 ,  *ゲノム ,  適応放散 ,  符号化 ,  ハコヤナギ属 ,  突然変異 ,  種分化
準シソーラス用語： 生殖隔離 ,  *適応進化 ,  *遺伝子流動 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： divergence ,  プールseq ,  Populus ,  二次接触 ,  選択 ,  化学

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  血液の腫よう  (GK04000M) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (7件)： エピソード ,  遺伝子流動 ,  樹種 ,  適応進化 ,  発散 ,  ゲノム ,  景観