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J-GLOBAL ID：201702280918175248   整理番号：17A1714931

Yersinia ruckeri感染に応答したアムールチョウザメひ臓のTrancriptomeプロファイル【Powered by NICT】

Trancriptome profiles of Amur sturgeon spleen in response to Yersinia ruckeri infection

著者 (9件)： Li Shaowu (Laboratory of Fish Diseases, Department of Aquaculture, Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070, PR China) ,  Li Shaowu (Heilongjiang Key Laboratory of Breeding and Aquaculture of Cold-water Fish, Harbin 150070, PR China) ,  Zhang Ying (Laboratory of Fish Diseases, Department of Aquaculture, Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070, PR China) ,  Zhang Ying (Heilongjiang Key Laboratory of Breeding and Aquaculture of Cold-water Fish, Harbin 150070, PR China) ,  Cao Yongsheng (Laboratory of Fish Diseases, Department of Aquaculture, Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070, PR China) ,  Wang Di (Laboratory of Fish Diseases, Department of Aquaculture, Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070, PR China) ,  Liu Hongbai (Laboratory of Fish Diseases, Department of Aquaculture, Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070, PR China) ,  Lu Tongyan (Laboratory of Fish Diseases, Department of Aquaculture, Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070, PR China) ,  Lu Tongyan (Heilongjiang Key Laboratory of Breeding and Aquaculture of Cold-water Fish, Harbin 150070, PR China)
資料名： Fish & Shellfish Immunology  (Fish & Shellfish Immunology)
巻： 70  ページ： 451-460  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1617A  ISSN： 1050-4648  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Yersinia ruckeri(YR)は養殖魚世界的に重要な経済的損失,アムールチョウザメ(Acipenser schrenckii)培養を含むを起こしているエルシニア感染症の病原体である。アムールチョウザメにおけるYRに対する免疫応答の機構をより良く理解するために,YR感染および非感染群からの脾臓のトランスクリプトームプロファイルはRNA-seq技術を用いて得た。de novo集合体は二つのライブラリーから全145670個の単遺伝子が得られた。YR感染および非感染群における転写産物の総数は110893年から147336年までの,平均長さ560~631(N50:882~1083)からであった。GO分析により,10038単一遺伝子が26生物学的過程のサブカテゴリー,17細胞成分のサブカテゴリーと19分子機能サブカテゴリーに分類されたことを明らかにした。全59487個の単一遺伝子であったKEGG経路注釈と免疫系に関係した二十の経路。千四百六十五の異なる発現遺伝子(DEG)を同定し,377のアップレギュレートされた遺伝子および1088のダウンレギュレートされた遺伝子を含む。125DEGはアムールチョウザメの免疫応答に関連し,さらに16免疫関連KEGG経路に分け,抗原プロセシングと提示,補体および凝固カスケード,T細胞受容体シグナル伝達経路,B細胞受容体シグナル伝達経路,NOD様受容体シグナル伝達経路,ケモカインシグナル伝達経路などを含めたであることが分かった。DEGの八はqRT-PCR法でさらに確認した。まとめると,本研究で得られた結果は,Y.ruckeri感染に対するアムールチョウザメの免疫応答への洞察を提供するであろう。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *感染 ,  トランスクリプトーム ,  *脾臓 ,  細胞構成体 ,  T細胞受容体 ,  培養 ,  免疫反応 ,  補体 ,  遺伝子 ,  病原体 ,  ケモカイン ,  *Yersinia
準シソーラス用語： 伝達経路 ,  KEGG ,  *Yersinia ruckeri , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Acipenser schrenckii ,  Yersinia ruckeri ,  トランスクリプトーム ,  DEGs ,  免疫応答

分類 (2件)： 感染免疫  (ED03030P) ,  生体防御と免疫系一般  (ED01010F)

タイトルに関連する用語 (5件)： Yersinia ,  感染 ,  応答 ,  ひ臓 ,  プロファイル