抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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低分子RNA(sRNA)の深い配列決定は植物におけるsRNA研究に広く用いられている。sRNAの配列頻度の変動を調べるために,イネ穀粒からの同じsRNA試料を深い配列決定法を用いて2回配列決定した。sRNAは,3つのカテゴリー,高い豊度(100のRPM),中程度の豊度(10-100RPM)および低い豊度(1-10RPM)に分類された。同じサンプルの反復配列データによると,高度に発現したsRNA(>100 RPM)はランダムドリフトに対してより少なく,2つのサンプル間のsRNA Log2比の95%は0.649と0.558の間にあった。同じ傾向は,中程度に発現されたsRNA(10-100RPM)で観察され,Log2比の95%は低い発現sRNA(1-10RPM)に対して-0.535と0.759.Asの間にあり,Log2比の95%は-1.009と1.011の間で変化した。これらの結果は,植物におけるsRNA研究において特異的に発現されたsRNAを見出すための理論的ガイドとして用いることができる。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】