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J-GLOBAL ID：201702281742235783   整理番号：17A1552574

結腸直腸癌ステージ分化における予後モジュールバイオマーカーを予測するためのmRNA miRNA二分ネットワーク再構築【Powered by NICT】

mRNA-miRNA bipartite network reconstruction to predict prognostic module biomarkers in colorectal cancer stage differentiation

著者 (5件)： Motieghader Habib (Laboratory of Systems Biology and Bioinformatics (LBB), Institute of Biochemistry and Biophysics, University of Tehran, Tehran, Iran. [e-mail]) ,  Kouhsar Morteza ,  Najafi Ali ,  Sadeghi Balal ,  Masoudi-Nejad Ali
資料名： Molecular BioSystems  (Molecular BioSystems)
巻： 13  号： 10  ページ： 2168-2180  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2331A  ISSN： 1742-206X  CODEN： MBOIBW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： バイオマーカー検出は癌研究で最も重要かつ挑戦的問題の一つである。最近,miRNA発現レベルのような非コードRNAに基づくバイオマーカーが多くのタイプの癌の早期診断に使用されてきた。本研究では,システム生物学的アプローチを用いて,初期段階におけるCRC診断のための新しいmiRNAに基づくバイオマーカーを検出した。三CRC段階(低悪性度上皮内腫瘍(LIN),高悪性度上皮内腫瘍(HIN)と腺癌)からのmRNA発現データを用いて,共発現ネットワークを再構築した。ネットワークは共発現モジュールを抽出するためにクラスタ化し,CRC段階間の低保存モジュールを検出した。,実験的に検証されたmRNA miRNA相互作用データは三mRNA miRNA二部ネットワークを再構築するために適用した。最高度(ハブmiRNA)と二十個のmiRNAは更なる分析をするため三二分サブネットワークを再構成するために各二部ネットワークを選択した。二部サブネットワークにおけるこれらのハブmiRNAの分析は,CRC段階における予後マーカーとしての30種類の重要なmiRNAを明らかにした。CRCにおいて今まで報告されていないこれら30ハブmiRNAの二種の新しいCRC関連miRNA(HSA miR190 3pとHSA miR1277 5p)である。,薬物遺伝子相互作用ネットワークは,CRC治療のための潜在的候補薬物を検出するために再構築した。解析の結果m RNA miRNA二分ネットワークにおけるハブmiRNAはCRC進行における非常に必須であり,今後の研究において正確に検討すべきであることを示した。添加では,CRC進行に重要である可能性があり,将来の研究における治療標的として解析できることを結果の多くの重要な標的遺伝子である。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： *mRNA ,  *バイオマーカー ,  クラスタ化 ,  *ネットワーク ,  腺癌 ,  相互作用 ,  上皮 ,  *再構成 ,  治療法 ,  早期診断
準シソーラス用語： 標的遺伝子 ,  共発現 ,  mRNA発現 ,  *マイクロRNA ,  *結腸直腸癌 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (10件)： 結腸直腸癌 ,  ステージ ,  分化 ,  予後 ,  モジュール ,  バイオマーカー ,  予測 ,  mRNA ,  miRNA ,  再構築