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J-GLOBAL ID：201702282544276710   整理番号：17A1922748

カラム型リンゴMdCoLBD1/2遺伝子バイオインフォマティクスとSNP分析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics and SNP Analysis of MdCoLBD1/2 Genes on Columnar Apple

著者 (7件)： Jiang Renzhen (青島農業大学園芸学院,青島,266109) ,  Liu Zhengli (栄成市人和鎮政府,栄成,264306) ,  Zhou Yaping (青島農業大学園芸学院,青島,266109) ,  Hou Hongmin (青島農業大学園芸学院,青島,266109) ,  Zhu Jun (青島農業大学園芸学院,青島,266109) ,  Dai Hongyi (青島農業大学園芸学院,青島,266109) ,  Zhang Yugang (青島農業大学園芸学院,青島 266109;青島市園芸植物遺伝改良与育種重点実験室,青島 266109)
資料名： Qingdao Nongye Daxue Xuebao (Ziran Kexue Ban)  (Qingdao Nongye Daxue Xuebao (Ziran Kexue Ban))
巻： 34  号： 2  ページ： 100-106  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3552A  ISSN： 1674-148X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 柱型リンゴ(Columnar apple)はリンゴ株型育種の貴重な資源である。相同遺伝子クローニング法を用いて、柱状型リンゴ「ウィキョウ」の一年生枝の休眠期の芽のcDNAをテンプレートとし、LOB DOMAINファミリー(LBD)の2つの相同遺伝子をクローニングし、MdCoLBD1/2と命名し、それぞれ195と240個のアミノ酸をコードした。この遺伝子はLBDファミリーの典型的な構造ドメインを有し、例えばCボックス、GASボックス、ロイシンラダー(Leu zipper)構造及びLOB Domain領域など、MdCoLBD1/2はそれぞれ10番染色体Chr10に位置する。18985568。19005801とMdCoLBD2 Chr10;18985594。その結果,MdCoLBD1/2と白ナシ,ブドウ,イチゴ,ヤシ,モモ,クルミの間のアミノ酸の類似性は,60%以上であることが示された。クラスタ分析は,MdCoLBD1と白ナシ,梅とイチゴの間の関係が近く,MdCoLBD2とブドウ,クルミの間の関係が近いことを示し,MdCoLBD1/2とアジアの綿と陸地綿の間のクラスタ化関係は遠かった。MdCoLBD1/2遺伝子が30の異なるタイプの材料における塩基配列の差異を分析することにより、MdCoLBD1が8つの塩基の相違点があり、MdCoLBD2は5つの塩基の相違点があることが分かった。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クラスタ化 ,  類似性 ,  陸地 ,  育種 ,  クラスタ分析 ,  cDNA ,  休眠 ,  *遺伝子 ,  ブドウ ,  クルミ ,  アミノ酸 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： クローニング ,  相同遺伝子 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 柱状リンゴ ,  側方器官の境界(LOB)ドメイン(LBD) ,  Md CoLBD1/2遺伝子 ,  一塩基多型(SNP)

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： カラム ,  リンゴ ,  遺伝子 ,  バイオインフォマティクス ,  SNP ,  分析