最大クリークと誘引法を用いた肥大型心筋症のアトラクタ【Powered by NICT】

Feng Ming-Jun; Chu Hui-Min; Shen Cai-Jie; He Bin; Du Xian-Feng; Yu Yi-Bo; Liu Jing; Chen Xiao-Min

文献

J-GLOBAL ID：201702282696876759 整理番号：17A0475352

最大クリークと誘引法を用いた肥大型心筋症のアトラクタ【Powered by NICT】

Attractors of hypertrophic cardiomyopathy using maximal cliques and attract methods

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資料名：
巻： 67 ページ： 194-199 発行年： 2017年
JST資料番号： H0201B ISSN： 1476-9271 CODEN： COCHDK 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

著者らの研究は,最大クリークアルゴリズムと誘引法のクラスタリングによる統合による肥大型心筋症(H CM)に関連した微分アトラクタモジュールを同定するようデザインした。ArrayExpressデータベースからH CM関連マイクロアレイデータを採用した。次に,正常およびH CMの蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークは,スピアマン相関係数(SCC)を用いて構築し,再重み付けした。,最大クリークは最大クリーク手法にクラスタリングによるPPIネットワークから発見された。その後,高度に重なり合ったクリークは相互接続による除去または併合し,モジュールが得られた。続いて,誘引法を用いて微分アトラクタモジュール,示差アトラクタモジュールにおける遺伝子の経路濃縮分析により後を同定した。4より小さいか,等しいノードを持つクリークを除去した後,正常およびH CM PPIネットワークにおける926と1118最大クリークをモジュール解析のために得た。,正常とH CMのPPIネットワークからの32と55モジュールが得られた。正常条件と比較して,同じまたは類似した遺伝子組成を持つ5モジュール対であった。attract法に基づいて,これら5モジュールを示差アトラクタであることを見出した。経路濃縮分析はプロテアソーム,リボソーム及び酸化的リン酸化は重要な経路であることを示した。プロテアソーム,リボソーム及び酸化的リン酸化は,H CMの病態生理学的役割を果たす可能性がある。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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著者キーワード (5件)： , , , ,

生物学的機能 , 分子・遺伝情報処理 , 遺伝子操作

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