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J-GLOBAL ID：201702282746713552   整理番号：17A0351583

ブルーベリーのEST-SSR分子マーカーの開発とその遺伝的多様性の分析【JST・京大機械翻訳】

Development of expressed sequence tag-derived simple sequence and genetic diversity analysis of blueberry

著者 (7件)： Sun Haiyue (College of Horticulture,Jilin Agricultural University) ,  Guo Ruixue (College of Horticulture,Shenyang Agricultural University) ,  Wang Jiahui (College of Horticulture,Shenyang Agricultural University) ,  Gai Yuzhuo (College of Horticulture,Jilin Agricultural University) ,  Liu Yushan (College of Horticulture,Jilin Agricultural University) ,  Dong Mei (College of Horticulture,Jilin Agricultural University) ,  Li Yadong (College of Horticulture,Jilin Agricultural University)
資料名： Xibei Nonglin Keji Daxue Xuebao(Zirankexueban)  (Xibei Nonglin Keji Daxue Xuebao(Zirankexueban))
巻： 44  号： 12  ページ： 172-180,191  発行年： 2016年 
JST資料番号： C5021A  ISSN： 1671-9387  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]本研究の目的は,ブルーベリーのEST配列におけるSSR遺伝子座の分布パターンを検討し,ブルーベリーのEST-SSRプライマーを開発し,ブルーベリー品種の遺伝的多様性の研究におけるその役割を分析することである。【方法】本研究では,91 91 5.0(5.0)を用いて,91 オンライン 5.0ソフトウェアにより30のプライマーを設計し,増幅 PREMIER 5.0ソフトウェアを用いて,30のプライマーをスクリーニングし,増幅効果の理想的プライマーをスクリーニングした。91の生殖質の多型をスクリーニングし,91の生殖質の系統樹を構築した。【結果】34の464遺伝子座にはSSRのSSR遺伝子座があり,913のSSR遺伝子座があり,それらの中でジヌクレオチドとトリヌクレオチドの反復が主要なSSR型であり,それぞれすべて%と81.27%%を占めた。異なるヌクレオチド数の反復モチーフの反復回数は大きく異なっていた。ブルーベリーのEST-SSR遺伝子座は11~15BPに集中していた。トリヌクレオチドとヘキサヌクレオチドの種類が最も多く,すべての反復基質の要素の頻度が最も高かった。設計された30対のプライマー対の17対は,供試ブルーベリーの生殖質において理想的なPCR産物を増幅し,17対のプライマーは多型であった。クラスタ分析の結果,遺伝的類似性係数が0.69のとき,供試ブルーベリーを4つのグループに分けることができた。[結論]EST-SSRマーカーは,ブルーベリー品種の同定と遺伝的多様性の分析に用いることができる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヌクレオチド ,  品種 ,  系統樹 ,  基質 ,  ソフトウェア ,  ジヌクレオチド ,  クラスタ分析 ,  *ブルーベリー
準シソーラス用語： 遺伝的類似性 ,  トリヌクレオチド ,  生殖質 ,  オンライン ,  EST配列 ,  *遺伝多様性 ,  *分子マーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Vaccinium ,  EST ,  SSR ,  genetic diversity

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： ブルーベリー ,  分子マーカー ,  開発 ,  遺伝的多様性 ,  分析