ゲノムワイドSNPジェノタイピングによって明らかとなったピーナッツにおける選択と四染色体における組換えの特徴

CLEVENGER Josh; CHU Ye; CHAVARRO Carolina; AGARWAL Gaurav; BERTIOLI David J.; BERTIOLI David J.; LEAL-BERTIOLI Soraya C.M.; LEAL-BERTIOLI Soraya C.M.; PANDEY Manish K.; VAUGHN Justin; ABERNATHY Brian; BARKLEY Noelle A.; HOVAV Ran; BUROW Mark; NAYAK Spurthi N.; CHITIKINENI Annapurna; ISLEIB Thomas G.; HOLBROOK C. Corley; JACKSON Scott A.; VARSHNEY Rajeev K.; OZIAS-AKINS Peggy

文献

J-GLOBAL ID：201702282985411720 整理番号：17A1009795

ゲノムワイドSNPジェノタイピングによって明らかとなったピーナッツにおける選択と四染色体における組換えの特徴

Genome-wide SNP Genotyping Resolves Signatures of Selection and Tetrasomic Recombination in Peanut

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著者 (21件)：

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巻： 10 号： 2 ページ： 309-322 発行年： 2017年02月13日
JST資料番号： W2375A ISSN： 1674-2052 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

抄録/ポイント：

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Arachis hypogaeaの栽培品種を含む20種について,ゲノム配列を決定し,SNPジェノタイピングアレイを開発した。アレイには,二倍体と四倍体の種から同定されたSNPが含まれている。384系統を用いて実際にアレイを試験したところ,ランナー型の品種に共通するSNPマーカーが同定され,正の選択を受けたゲノム領域が推測できた。また,四倍体において組換えが起こった領域を示すSNPマーカーが同定された。

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