抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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次世代シークエンシング(NGS)データを解析するためのソフトウェアツールの開発はバイオインフォマティクス分野における緊急タスクの一つである。現在,ロット次世代シーケンシングデータ解析ソフトウェアを開発した。しかし,それらの大部分は,コマンド株による配列アラインメントまたは機能アノテーションのような分析の一つのタイプをサポートするのみである。,より少ない配置とNGSデータの優しいユーザインタフェイスが必要である。本論文では,高性能計算環境上で動作するウェブベース自動パイプラインを紹介した。生データはイルミネ配列決定装置から発生した。GATK基づく並列整流方式を用いて,結果を制御し,発生させた。パイプラインはfastQファイルグラフィカルインターフェイスによるアップロードから始まる。データを自動的に解析した。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】