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J-GLOBAL ID：201702283503166227   整理番号：17A0763724

HIV-1糖タンパク質-41への小分子結合を特徴付けるリガンドベースNMRスクリーニング法の評価

Evaluation of ligand-based NMR screening methods to characterize small molecule binding to HIV-1 glycoprotein-41

著者 (3件)： Chu Shidong (Department of Basic Sciences, Touro University-California, Vallejo, CA 94592, USA. [e-mail]) ,  Zhou Guangyan ,  Gochin Miriam
資料名： Organic & Biomolecular Chemistry  (Organic & Biomolecular Chemistry)
巻： 15  号： 24  ページ： 5210-5219  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0499C  ISSN： 1477-0520  CODEN： OBCRAK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 糖タンパク質-41(gp41)の小分子阻害剤は,gp41外部ドメイン内に含まれる疎水性ポケット(HP)に結合し,融合の進行を妨げることによってHIV感染を防止することができる。リガンドの疎水性,折りたたまれたgp41外部ドメインにおけるHPの閉塞,および複合体の結晶の形成の欠如のために,gp41-リガンド複合体に関する構造情報はほとんどない。ここでは,暴露されたHPと弱い親和性でHPに結合するように設計された小分子を含む,設計されたgp41外部ドメインタンパク質を使用した。我々は,複合体の形成および構造を探知する能力について,WaterLOGSY,Saturation Transfer Difference分光法(STD-NMR)および標的緩和(DIRECTION)を伴うおよび伴わない1H緩和速度差分光法を含むNMR法を評価した。WaterLOGSYは,複合体の形成をモニターする最も感度の高い手法だった。STD-NMRおよびDIRECTION実験は,同様のファーマコフォアマッピングプロファイルを示したが,DIRECTION実験の低いダイナミックレンジは,その識別および感度を制限した。STDデータから固有の結合ポーズが識別され,将来の最適化の手掛かりが得られた。技術の利点と欠点が議論される。これは,gp41小分子複合体の構造解析にSTDを使用した最初の例である。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST

シソーラス用語： *HIV1 ,  *糖タンパク質 ,  スクリーニング ,  NMR【磁気共鳴】 ,  *分子標的治療薬 ,  *構造解析 ,  ダイナミックレンジ ,  緩和速度 ,  スペクトロスコピー ,  *分子構造
準シソーラス用語： NMRスクリーニング法 ,  STD-NMR ,  緩和速度差分光法 ,  *小分子阻害剤

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  高分子固体の構造と形態学  (CG02022M)

物質索引 (1件)： 3-[6-(5-ピリミジニル)-1H-インドール-1-イルメチル]安息香酸

タイトルに関連する用語 (7件)： HIV-1 ,  糖タンパク質 ,  小分子 ,  リガンド ,  NMR ,  スクリーニング法 ,  評価