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J-GLOBAL ID：201702283632836867   整理番号：17A1629680

低及び高環境温度に順化させたメダカの筋肉組織における網羅的遺伝子発現解析【Powered by NICT】

Global gene expression analysis of the muscle tissues of medaka acclimated to low and high environmental temperatures

著者 (8件)： Ikeda Daisuke (School of Marine Biosciences, Kitasato University, Sagamihara, Kanagawa 252-0373, Japan) ,  Koyama Hiroki (School of Marine Biosciences, Kitasato University, Sagamihara, Kanagawa 252-0373, Japan) ,  Koyama Hiroki (Graduate School of Biosphere Science, Hiroshima University, Higashi-Hiroshima, Hiroshima 739-8528, Japan) ,  Mizusawa Nanami (School of Marine Biosciences, Kitasato University, Sagamihara, Kanagawa 252-0373, Japan) ,  Kan-no Nobuhiro (School of Marine Biosciences, Kitasato University, Sagamihara, Kanagawa 252-0373, Japan) ,  Tan Engkong (Department of Aquatic Bioscience, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Bunkyo, Tokyo 113-8657, Japan) ,  Asakawa Shuichi (Department of Aquatic Bioscience, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, The University of Tokyo, Bunkyo, Tokyo 113-8657, Japan) ,  Watabe Shugo (School of Marine Biosciences, Kitasato University, Sagamihara, Kanagawa 252-0373, Japan)
資料名： Comparative Biochemistry and Physiology. D. Genomics & Proteomics  (Comparative Biochemistry and Physiology. D. Genomics & Proteomics)
巻： 24  ページ： 19-28  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2148A  ISSN： 1744-117X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： メダカ(Oryzias latipes)は年間を通じてほぼ零から30°C以上までの範囲の水の広い温度範囲で生存できることを温帯広温性の魚である;温度順化を通してその正常な生理的および生化学的過程を維持する。魚の温度順応に関与する機構を決定するために,メダカの速骨格筋組織は次世代シーケンシングを用いた網羅的遺伝子発現解析を行った。十個体は24°Cで二水族館に設置した。一水槽の水温が10°Cに低下したが,他の水族館のそれは30°Cに増加した;これらの温度は,その後5週間維持された。RNAシークエンシング(RNA-Seq)分析は,エネルギー代謝と筋萎縮に関与する11遺伝子は10°Cに順応した魚における高度に発現したことを明らかにした。一方,有意に高い発現レベルは30°Cに順応した魚における筋原線維蛋白質と熱ショック蛋白質をコードする20遺伝子で観察された。さらに1103個の遺伝子は,少なくとも順化群の間で4倍の差次的発現を有していた。Genes and Genomes(KEGG)の遺伝子オントロジー(GO)と京都百科事典は重要な情報を提供した解析:代謝過程に関連した遺伝子の発現が活性化されたが,筋萎縮は10°Cに順応した魚で発生し,筋細胞は30°Cに順応した魚における活発に分け,熱ショック蛋白質を発現することにより熱応力を回避した。,利用可能なゲノムデータベースを用いたRNA-Seq解析は魚の温度順応に関与する分子機構をより良く理解するために有用であろう。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *メダカ ,  RNA【核酸】 ,  骨格筋 ,  *遺伝子 ,  *順応 ,  水温 ,  熱ショックタンパク質 ,  筋萎縮症 ,  水族館 ,  エネルギー代謝
準シソーラス用語： 遺伝子オントロジー ,  差次的遺伝子発現 ,  RNA-seq ,  次世代シークエンシング ,  *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： メダカ ,  次世代配列決定 ,  RNA-Seq解析 ,  温度順化 ,  筋

分類 (2件)： 動物に対する影響  (EE05040R) ,  その他の汚染原因物質  (SB05040W)

タイトルに関連する用語 (5件)： 環境温度 ,  順化 ,  メダカ ,  筋肉組織 ,  網羅的遺伝子発現解析