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J-GLOBAL ID：201702283784375382   整理番号：17A1994045

核トポロジーは癌ゲノムの変異ランドスケープを調節する

Nuclear topology modulates the mutational landscapes of cancer genomes

著者 (8件)： SMITH Kyle S (Rutgers Cancer Inst. New Jersey, New Jersey, USA) ,  SMITH Kyle S (Univ. Colorado Denver, Colorado, USA) ,  LIU Lin L (Harvard T.H. Chan School of Public Health, Massachusetts, USA) ,  LIU Lin L (Harvard Univ., Massachusetts, USA) ,  GANESAN Shridar (Rutgers Cancer Inst. New Jersey, New Jersey, USA) ,  MICHOR Franziska (Harvard T.H. Chan School of Public Health, Massachusetts, USA) ,  MICHOR Franziska (Harvard Univ., Massachusetts, USA) ,  DE Subhajyoti (Rutgers Cancer Inst. New Jersey, New Jersey, USA)
資料名： Nature Structural & Molecular Biology  (Nature Structural & Molecular Biology)
巻： 24  号： 11  ページ： 1000-1006  発行年： 2017年11月 
JST資料番号： W0637A  ISSN： 1545-9993  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 様々な種類のがんのゲノムワイド体細胞変異を解析し,染色体位置と体細胞変異の関係性を調べた。黒色腫(25サンプル),肺扁平上皮癌(31サンプル),胃癌(100サンプル),びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(40サンプル),慢性リンパ性白血病(150サンプル),および前立腺癌(20サンプル)を対象とした。核周縁部に位置する染色体18(chr18)と核中心部に位置するchr19を比較したところ,chr18におけるゲノムの塩基対あたりの変異検出頻度で調整した調整変異率(AMR)が,Chr19のそれよりいずれの癌においても高いことが分かった。さらに,ラミンAおよびラミンB1に関するクロマチン免疫沈降データに基づいて,核内の位置とAMRの関係を調べたところ,同一染色体内でも核周縁部に位置していた場合の方がAMRが高いことが分かった。核内での位置が癌ゲノムの体細胞変異ランドスケープに影響を及ぼすと結論付けた。

シソーラス用語： *細胞核 ,  *位相幾何学 ,  *突然変異 ,  *ゲノム ,  *腫瘍 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  黒色腫 ,  肺腫瘍 ,  扁平上皮癌 ,  胃腫瘍 ,  B細胞リンパ腫 ,  リンパ性白血病 ,  慢性白血病 ,  前立腺腫瘍 ,  ヘテロクロマチン ,  塩基対 ,  解析 ,  分布 ,  核構成タンパク質 ,  免疫沈降反応
準シソーラス用語： 体細胞変異 ,  染色体位置決め ,  肺扁平上皮癌 ,  びまん性大細胞型B細胞リンパ腫 ,  慢性リンパ性白血病 ,  突然変異検出 ,  変異率 ,  ラミンA ,  ラミンB1 ,  クロマチン免疫沈降

分類 (4件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝的変異  (EC01030Y) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

タイトルに関連する用語 (6件)： 核 ,  トポロジー ,  癌ゲノム ,  変異 ,  ランドスケープ ,  調節