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J-GLOBAL ID：201702283817174277   整理番号：17A0281346

連鎖地図作製における確率的グラフィカルモデルの有用性

The potential of probabilistic graphical models in linkage map construction

著者 (3件)： WANG Huange (Wageningen Univ., Wageningen, NLD) ,  VAN EEUWIJK Fred A. (Wageningen Univ., Wageningen, NLD) ,  JANSEN Johannes (Wageningen Univ., Wageningen, NLD)
資料名： Theoretical and Applied Genetics  (Theoretical and Applied Genetics)
巻： 130  号： 2  ページ： 433-444  発行年： 2017年02月 
JST資料番号： D0382B  ISSN： 0040-5752  CODEN： THAGA6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 連鎖地図の作製は,遺伝子型決定の過誤や逆位と転座のような染色体再配列によってさまたげられることがわかっている。本研究では,グラフ理論と確率論を組み合わせた確率的グラフィカルモデルを用いて,連鎖地図作製のための新しい方法の開発を行った。その結果,開発された方法は,遺伝子型決定の過誤を含むマーカーをフィルタリングで除去するのに理論的にも実用的にも有効であることが示された。このモデルでは,特に,マーカーのフィルタリングと順序付けを同時に行うので,最近傍ストレスを用いた標準的な事後フィルタリングより優れていることがわかった。こうした結果から,確率的グラフィカルモデルは,遺伝子型決定の過誤や相互転座に起因するデータ攪乱の存在にもかかわらず,ロバスト性と信頼性の高い連鎖地図の作製に有用であることが明らかとなった。

シソーラス用語： *連鎖地図 ,  遺伝学実験技術 ,  染色体異常 ,  転座 ,  DNAマーカー ,  ストレス ,  *確率モデル
準シソーラス用語： 遺伝子型決定 ,  *確率的グラフィカルモデル ,  最近傍ストレス ,  染色体再配列 ,  相互転座

分類 (1件)： 遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (4件)： 連鎖地図 ,  作製 ,  確率的グラフィカルモデル ,  有用性