文献

J-GLOBAL ID：201702284331971342   整理番号：17A1343088

LPI ETSLP固有値変換ベース半教師つきリンク予測を用いたlncRNA蛋白質相互作用予測【Powered by NICT】

LPI-ETSLP: lncRNA-protein interaction prediction using eigenvalue transformation-based semi-supervised link prediction

著者 (7件)： Hu Huan (School of Life Science, Liaoning University, Shenyang, 110036, China. [e-mail]) ,  Zhu Chunyu ,  Ai Haixin ,  Zhang Li ,  Zhao Jian ,  Zhao Qi ,  Liu Hongsheng
資料名： Molecular BioSystems  (Molecular BioSystems)
巻： 13  号： 9  ページ： 1781-1787  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2331A  ISSN： 1742-206X  CODEN： MBOIBW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA-蛋白質相互作用は,多くの重要な細胞過程を理解するために必須である。特に,lncRNA蛋白質相互作用は転写後遺伝子調節,スプライシング,翻訳,シグナル伝達と複雑な疾患の進行などに重要な役割を果たしている。しかし,lncRNA蛋白質相互作用の実験的検証は時間がかかり,高価で,ごく少数の理論的方法は潜在的lncRNA蛋白質会合を予測するために利用可能である。本稿で,著者らはlncRNAと蛋白質の間の関係を明らかにするために固有値変換に基づく半教師つきリンク予測(LPI ETSLP)を示した。さらに,半教師つきであり,負の試料を必要としない。5倍交差検証法に基づいて,0.8876のAUCと0.6438のAUPRは他の三計算モデルと比較して信頼性のある性能を実証した。さらに,事例研究は,著者らの方法により予測された多くのlncRNA蛋白質相互作用を実験により確認することに成功できることを示した。LPI ETSLPは生物医学研究のための有用なバイオインフォマティクス資源であることが示唆された。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： *タンパク質 ,  事例研究 ,  交差検証法 ,  *固有値 ,  計算モデル ,  *予測 ,  遺伝的調節 ,  信頼性
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  生物医学研究 ,  RNA-蛋白質相互作用 ,  *蛋白質間相互作用 ,  *非翻訳長鎖RNA , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 固有値 ,  教師 ,  リンク ,  予測 ,  lncRNA ,  蛋白質相互作用