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J-GLOBAL ID：201702284671918329   整理番号：17A0621801

集団規模の非ターゲットメタボロミクスデータにおけるスペクトルのドリフトの可視化,定量化,およびアライメント

Visualization, Quantification, and Alignment of Spectral Drift in Population Scale Untargeted Metabolomics Data

著者 (9件)： WATROUS Jeramie D. (Univ. California San Diego, California, USA) ,  HENGLIN Mir (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  CLAGGETT Brian (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  LEHMANN Kim A. (Univ. California San Diego, California, USA) ,  LARSON Martin G. (Framingham Heart Study, Massachusetts, USA) ,  LARSON Martin G. (Boston Univ., Massachusetts, USA) ,  CHENG Susan (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  CHENG Susan (Framingham Heart Study, Massachusetts, USA) ,  JAIN Mohit (Univ. California San Diego, California, USA)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 89  号： 3  ページ： 1399-1404  発行年： 2017年02月07日 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： LC-MS分析により得られた大規模なメタボロミクスデータを解析しようとする場合には,個々のデータのクロマトグラフィーの保持時間のドリフトは,解析の妨げとなる。本研究では,保持時間のドリフト,あるいは試料の調製等に起因するバッチ効果を,一回の分析により補正し,大規模なLC-MSデータの統計的解析が行えるようなソフトウェアの開発を行った。このソフトウェアはR言語により書かれ,3つの部分から成る。実際に,2895人の被験者に由来する血漿のメタボロミクスデータの解析に適用し,その有効性を示した。

シソーラス用語： *データ解析 ,  保持時間 ,  *LC-MS分析 ,  解析 ,  ドリフト ,  統計解析 ,  ソフトウェア ,  プログラミング言語 ,  プログラムパッケージ ,  血漿 ,  集団 ,  *コホート研究 ,  クラスタ化 ,  アラインメント ,  液体クロマトグラフィー
準シソーラス用語： R言語 ,  *メタボロミクス ,  階層的クラスタリング ,  *大規模コホート研究

分類 (4件)： 有機化合物の各種分析  (CC08034J) ,  血液検査  (GC02050D) ,  生体物質一般  (EB02010G) ,  その他の計算機利用技術  (JE14000C)

タイトルに関連する用語 (7件)： 集団 ,  規模 ,  スペクトル ,  ドリフト ,  可視化 ,  定量化 ,  アライメント