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J-GLOBAL ID：201702285419577101   整理番号：17A1167899

世界で最も深い生きている動物における分子適応:超深海端脚類Hirondellea gigasのトランスクリプトーム配列決定からの洞察【Powered by NICT】

Molecular adaptation in the world’s deepest-living animal: Insights from transcriptome sequencing of the hadal amphipod Hirondellea gigas

著者 (12件)： Lan Yi (Division of Life Science, Hong Kong University of Science and Technology, Kowloon, Hong Kong, China) ,  Sun Jin (Division of Life Science, Hong Kong University of Science and Technology, Kowloon, Hong Kong, China) ,  Tian Renmao (Division of Life Science, Hong Kong University of Science and Technology, Kowloon, Hong Kong, China) ,  Bartlett Douglas H. (Scripps Institution of Oceanography, University of California, San Diego, La Jolla, CA, USA) ,  Li Runsheng (Department of Biology, Hong Kong Baptist University, Hong Kong, China) ,  Wong Yue Him (Division of Life Science, Hong Kong University of Science and Technology, Kowloon, Hong Kong, China) ,  Zhang Weipeng (Division of Life Science, Hong Kong University of Science and Technology, Kowloon, Hong Kong, China) ,  Qiu Jian-Wen (Department of Biology, Hong Kong Baptist University, Hong Kong, China) ,  Xu Ting (Department of Biology, Hong Kong Baptist University, Hong Kong, China) ,  He Li-Sheng (Institute of Deep Sea Science and Engineering, Chinese Academy of Sciences, Sanya, Hainan, China) ,  Tabata Harry G. (Division of Life Science, Hong Kong University of Science and Technology, Kowloon, Hong Kong, China) ,  Qian Pei-Yuan (Division of Life Science, Hong Kong University of Science and Technology, Kowloon, Hong Kong, China)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 26  号： 14  ページ： 3732-3743  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マリアナ海溝のチャレンジャー海淵は地球の海洋の最深点である。動物は高静水圧,食物制限,暗状態と冷によって特性化されたこの過酷な環境に適応するかを理解することは,大きな科学的関心事である。チャレンジャー海淵に生息動物のうち,端脚類は餌トラップを用いて捕捉した。本研究では,チャレンジャー海淵の東池から10,929mの深さで採取した端脚類Hirondellea gigasのトランスクリプトームを配列決定した。これらの配列の集合は,133,041のコンティグと22,046の翻訳された蛋白質をもたらした。これらのコンティグの機能的注釈は,ゴーとkeggデータベースを用いて行った。四浅海端脚類のこれらの翻訳された蛋白質の比較は,10,731遺伝子ファミリー,そのうちの5659は単一コピーオーソロガス遺伝子を明らかにした。これらの単一コピーオーソロガス遺伝子の塩基置換解析は,62の遺伝子がH.gigas,β-アラニン生合成,エネルギー代謝と遺伝子情報処理に関連する遺伝子を含む正に淘汰されることを示した。多コピーオーソロガス遺伝子では,遺伝子ファミリーの拡大解析は低温誘導性蛋白質(即ち,転写因子IIAと転写伸長因子1)及び亜鉛フィンガードメインはH.gigasに展開したことを明らかにした。全体として,著者らの結果は,H.gigasによる超深海環境への遺伝的適応は特異的蛋白質の遺伝子ファミリーの拡大とアミノ酸置換の両方により仲介されることを示した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *端脚類 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  転写因子 ,  キャラクタリゼーション ,  *トランスクリプトーム ,  生合成 ,  アノテーション ,  データベース ,  *深海 ,  塩基対置換
準シソーラス用語： オルソログ遺伝子 ,  遺伝子ファミリー ,  コンティグ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： チャレンジャー海淵 ,  深海 ,  静水圧 ,  マリアナ海溝 ,  の正の選択

分類 (4件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  動物の生化学  (EJ01050P) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 世界 ,  動物 ,  分子適応 ,  深海 ,  端脚類 ,  トランスクリプトーム ,  洞察