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J-GLOBAL ID：201702286883424094   整理番号：17A1738166

16S rRNA及び機能遺伝子に基づくPCRプライマーを用いた異なる環境試料における嫌気性アンモニア酸化(Anammox)細菌の分子検出の評価

Assessment of molecular detection of anaerobic ammonium-oxidizing (anammox) bacteria in different environmental samples using PCR primers based on 16S rRNA and functional genes

著者 (10件)： HAN Ping (Univ. Hong Kong, Hong Kong, CHN) ,  KLUEMPER Uli (Univ. Hong Kong, Hong Kong, CHN) ,  KLUEMPER Uli (Univ. Duisburg-Essen, Duisburg, DEU) ,  WONG Alex (Univ. Hong Kong, Hong Kong, CHN) ,  LI Meng (Shenzhen Univ., Shenzhen, CHN) ,  LIN Jih-Gaw (National Chiao Tung Univ., Hsinchu, TWN) ,  QUAN Zhexue (Fudan Univ., Shanghai, CHN) ,  DENECKE Martin (Univ. Duisburg-Essen, Essen, DEU) ,  GU Ji-Dong (Univ. Hong Kong, Hong Kong, CHN) ,  GU Ji-Dong (City Univ. Hong Kong, Hong Kong SAR, CHN)
資料名： Applied Microbiology and Biotechnology  (Applied Microbiology and Biotechnology)
巻： 101  号： 20  ページ： 7689-7702  発行年： 2017年10月 
JST資料番号： H0764A  ISSN： 0175-7598  CODEN： EJABDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Anammox細菌の16S rRNAを標的化する総計11プライーマーセットのうち,hzo遺伝子(4セット),nirS遺伝子(2セット)及びhzsA遺伝子(2セット)を選択し,下水処理場(WWTP),Mai Po自然保護区(MP)の湿地及び南シナ海由来の3環境試料におけるAnammox細菌の多様性及び豊度を研究した。WWTPは最も低い多様性を示し,MPは最も高いそれを保持し,新しい機能遺伝子クラスターはAnammox細菌の異なる属間の多様な代謝メカニズムを示した。またプライマーを評価し,検出したAnammox細菌において大部分は高い効率性及び特異性を示したが,一部は選択性及び低い特異性を示した。これらの結果から,Anammox細菌の分布は異なる生態系においてニッチ特異的であり,プライマー特異性は検出された多様性にバイアスをもたらすことを示唆した。

シソーラス用語： *細菌 ,  嫌気性処理 ,  微生物学的酸化 ,  *環境試料 ,  rRNA ,  ヌクレオチド配列 ,  *系統発生 ,  系統樹 ,  種差 ,  相同性 ,  *ケモタキソノミー ,  窒素循環 ,  遺伝子 ,  プライマー【遺伝】 ,  PCR法 ,  生物多様性 ,  豊度 ,  検出 ,  *細菌検査
準シソーラス用語： 16S rRNA ,  *Anammox細菌 ,  hzsA遺伝子 ,  hzo遺伝子 ,  nirS遺伝子 ,  PCRプライマー ,  機能遺伝子 ,  嫌気性アンモニア酸化 ,  微生物多様性 ,  分子検出

分類 (3件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  微生物の生態  (EG03040J) ,  微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (9件)： rRNA ,  機能遺伝子 ,  PCRプライマー ,  環境試料 ,  嫌気性アンモニア酸化 ,  Anammox ,  細菌 ,  分子検出 ,  評価