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J-GLOBAL ID：201702286930578392   整理番号：17A0388414

Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110代謝ネットワークの構築とシミュレーション:自由生活および共生状態間の比較【Powered by NICT】

Construction and simulation of the Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110 metabolic network: a comparison between free-living and symbiotic states

著者 (3件)： Yang Yi (Hubei Key Laboratory of Agricultural Bioinformatics, College of Informatics, State Key Laboratory of Agricultural Microbiology, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China. [e-mail]) ,  Hu Xiao-Pan ,  Ma Bin-Guang
資料名： Molecular BioSystems  (Molecular BioSystems)
巻： 13  号： 3  ページ： 607-620  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2331A  ISSN： 1742-206X  CODEN： MBOIBW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Bradyrhizobium diazoefficiensはダイズとの双利共生を確立することによりアンモニウムへの大気窒素を変換できる根粒菌である。微生物剤の重要な親株として認識されており,農業および環境分野で広く応用されている。共生的窒素固定の代謝特性と自由生活細胞と共生バクテロイドの間の差異を研究するために,B.diazoefficiens USDA110のゲノムスケール代謝ネットワークを構築し,解析した。iYY1101,代謝ネットワークは全体で千三十一の反応,661,及び1101の遺伝子を含んでいる。自由生活および共生状態を反映した代謝モデルは対応する目的関数と基板入力集合を定義することにより決定し,さらにのハイスループットなトランスクリプトミクスおよびプロテオミクスデータによって制約された。制約に基づく流束解析を用いて代謝能力と二生理的状態間の遺伝子と反応の代謝標的への影響を比較することであった。結果は自由生活根粒菌はバイオマス前駆体の複雑な供給を維持するための定常状態流束分布を持つ共生バクテロイドは窒素固定に適応した比較的縮合の度合いを維持することを示した。代謝モデルは,この種の共生的窒素固定をより良く理解するための有望なプラットフォームとして役立つ可能性がある。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： アンモニウムイオン ,  窒素固定 ,  窒素 ,  バイオマス ,  目的関数 ,  根粒菌属 ,  *代謝 ,  ダイズ ,  *Bradyrhizobium
準シソーラス用語： 定常状態 ,  トランスクリプトーム解析 ,  ハイスループット ,  バクテロイド ,  共生窒素固定 ,  *代謝ネットワーク , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 代謝と栄養  (EG03054K) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (5件)： Bradyrhizobium ,  代謝ネットワーク ,  構築 ,  シミュレーション ,  共生