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J-GLOBAL ID：201702287073927412   整理番号：17A1429099

miRTarVis+:マイクロRNA標的予測のためのウェブベースの対話型視覚分析ツール【Powered by NICT】

miRTarVis+: Web-based interactive visual analytics tool for microRNA target predictions

著者 (10件)： L’Yi Sehi (Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University, 1 Gwanak-ro, Gwanak-gu, Seoul 151-742, Republic of Korea) ,  Jung Daekyoung (Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University, 1 Gwanak-ro, Gwanak-gu, Seoul 151-742, Republic of Korea) ,  Oh Minsik (Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University, 1 Gwanak-ro, Gwanak-gu, Seoul 151-742, Republic of Korea) ,  Kim Bohyoung (Division of Biomedical Engineering, Hankuk University of Foreign Studies, 81 Oedae-ro, Mohyeon-myeon, Cheoin-gu, Yongin-si, Gyeonggi-do 449-791, Republic of Korea) ,  Freishtat Robert J. (Division of Emergency Medicine, Children’s National Medical Center, 111 Michigan Avenue, NW, Washington, DC 20010, USA) ,  Freishtat Robert J. (Center for Genetic Medicine Research, Children’s National Medical Center, 111 Michigan Avenue, NW, Washington, DC 20010, USA) ,  Freishtat Robert J. (Department of Integrative Systems Biology, George Washington University, 111 Michigan Avenue, NW, Washington, DC 20010, USA) ,  Giri Mamta (Center for Genetic Medicine Research, Children’s National Medical Center, 111 Michigan Avenue, NW, Washington, DC 20010, USA) ,  Hoffman Eric (School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, Binghamton University, 4400 Vestal Parkway East, Binghamton, NY 13902, USA) ,  Seo Jinwook (Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University, 1 Gwanak-ro, Gwanak-gu, Seoul 151-742, Republic of Korea)
資料名： Methods  (Methods)
巻： 124  ページ： 78-88  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0241A  ISSN： 1046-2023  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本論文では,miRTarVis+,miRNA標的予測のためのWebベース対話型視覚分析ツールと複数の予測結果の統合的分析を提示した。miRNA mRNA発現プロファイルデータを利用することにより配列に基づくmiRNA標的予測を改善するために開発した種々のマイクロRNA(miRNA)標的予測アルゴリズム。も研究者は,miRNAの標的の予測を支援するためのいくつかの解析ツール。しかし,miRNA予測アルゴリズムのための,より重要なことは複数の予測結果の統合分析のための対話型可視化ツールの性能を改善するために必要である。miRTarVis+は負荷の解析パイプラインを支持し,フィルタリング,予測し,可視化するために直観的なインタフェイスを持っている。Bayes推論を採用することにより,miRNAの標的を予測でき,最大情報に基づくノンパラメトリック探査(MINE)は従来の相関と相互情報量解析と同様に解析した。miRTarVis+は,複数の予測結果の概要を提供し,その後にユーザが対話型treemapとノードリンク図において選択されたmiRNA mRNAネットワークを調べるために可能にすることにより,複数の予測結果の統合的解析を支持した。miRTarVis+の有効性を評価するために著者らは,喘息と乳癌患者のmiRNA mRNA発現プロファイルデータを用いた二つの事例研究を行い,miRTarVis+は,ユーザがより包括的にmiRNA-mRNA発現プロファイルデータからのmiRNAの標的を解析できることを示した。miRTarVis+であるhttp://hcil.snu.ac.kr/research/mirtarvisplusで利用可能である。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *視覚 ,  インタフェイス ,  *予測 ,  ネットワーク ,  事例研究 ,  Bayes推定 ,  mRNA ,  フィルタリング ,  乳房腫瘍 ,  可視化 ,  Web【情報システム】
準シソーラス用語： 遺伝子発現プロファイリング ,  *対話型 ,  *標的予測 ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： マイクロRNA ,  mRNA ,  Visualization ,  発現プロファイル ,  標的予測 ,  統合解析

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： マイクロRNA ,  標的予測 ,  ウェブ ,  対話型 ,  視覚分析 ,  ツール