文献

J-GLOBAL ID：201702287345638988   整理番号：17A0460886

MTD 遺伝子の発現および制御を調べるための哺乳類トランスクリプトームデータベース

MTD: a mammalian transcriptomic database to explore gene expression and regulation

著者 (10件)： SHENG Xin (Univ. Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  WU Jiayan (Beijing Inst. Genomics, Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  SUN Qianqian (Univ. Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  LI Xue (Univ. Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  XIAN Feng (Univ. Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  SUN Manman (Hunan Agricultural Univ., Hunan, CHN) ,  FANG Wan (Univ. Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  CHEN Meili (Beijing Inst. Genomics, Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  YU Jun (Beijing Inst. Genomics, Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  XIAO Jingfa (Beijing Inst. Genomics, Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN)
資料名： Briefings in Bioinformatics  (Briefings in Bioinformatics)
巻： 18  号： 1  ページ： 28-36  発行年： 2017年01月 
JST資料番号： W2342A  ISSN： 1467-5463  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 哺乳類のトランスクリプトームに注目した哺乳類トランスクリプトームデータベース(MTD)について示した。MTDでは,隣接する遺伝子座標あるいはジョイントKEGGパスウェイに基づいて遺伝子を閲覧し,ゲノムブラウザーに統合することにより,エクソン,転写産物および遺伝子の発現情報を得ることができた。MTDにより,ユーザー定義転写特性をもつ遺伝子あるいはアイソフォームの柔軟な検索が可能となり,テーブルベースの記述および関連可視化が可能となった。また,MTDにより種内および種間の比較トランスクリプトーム解析も可能となった。以上より,MTDはトランスクリプトーム研究および進化研究のための有用なリソースであることが示された。MTDはウェブサイトから自由にアクセス可能である。

シソーラス用語： 哺乳類 ,  *トランスクリプトーム ,  *データベース ,  *遺伝子発現 ,  遺伝的調節 ,  遺伝学実験技術 ,  遺伝子 ,  エキソン ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： KEGG ,  RNAアイソフォーム ,  *RNA-seq ,  *遺伝子制御

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： MTD ,  遺伝子 ,  発現 ,  哺乳類 ,  トランスクリプトーム ,  データベース