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J-GLOBAL ID：201702288059149682   整理番号：17A1000032

神経膠芽腫のための細胞表面膜蛋白質シグネチャ【Powered by NICT】

A Cell-Surface Membrane Protein Signature for Glioblastoma

著者 (13件)： Ghosh Dhimankrishna (Institute for Systems Biology, Seattle, WA 98109, USA) ,  Funk Cory C. (Institute for Systems Biology, Seattle, WA 98109, USA) ,  Caballero Juan (Institute for Systems Biology, Seattle, WA 98109, USA) ,  Shah Nameeta (The Ben and Catherine Ivy Center for Advanced Brain Tumor Treatment, Swedish Neuroscience Institute, Seattle, WA 98122, USA) ,  Rouleau Katherine (Institute for Systems Biology, Seattle, WA 98109, USA) ,  Earls John C. (Institute for Systems Biology, Seattle, WA 98109, USA) ,  Earls John C. (Department of Computer Science and Engineering, University of Washington, Seattle, WA 98195, USA) ,  Soroceanu Liliana (California Pacific Medical Center Research Institute, San Francisco, CA 94107, USA) ,  Foltz Greg (The Ben and Catherine Ivy Center for Advanced Brain Tumor Treatment, Swedish Neuroscience Institute, Seattle, WA 98122, USA) ,  Cobbs Charles S. (The Ben and Catherine Ivy Center for Advanced Brain Tumor Treatment, Swedish Neuroscience Institute, Seattle, WA 98122, USA) ,  Price Nathan D. (Institute for Systems Biology, Seattle, WA 98109, USA) ,  Price Nathan D. (Department of Computer Science and Engineering, University of Washington, Seattle, WA 98195, USA) ,  Hood Leroy (Institute for Systems Biology, Seattle, WA 98109, USA)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 4  号： 5  ページ： 516-529.e7  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 神経膠芽腫(GBM)のための分子標識の開発,33細胞表面膜貫通蛋白質から成るを促進することをシステム戦略を提示した。分子署名,GBMSig,REMBRANDT(n=228)とTCGAデータセット(n=547)における患者腫瘍からの細胞表面プロテオミクスとトランスクリプトミクスの統合により開発し,ロックダウン試験におけるMatthewの相関係数0.87の対照個人からGBM患者を分離することができる。機能的に,17/33GBMSig蛋白質は形質転換成長因子βシグナル伝達経路に関連する,CD47,SLC16A1、HMOX1及びMRC2を含んでいる。これらの遺伝子のノックダウンはGBM浸潤を損ない,GBM疾患摂動変化におけるそれらの役割を反映している。多重臨床現場から84血漿試料にGBMSig(CD44,VCAM1,HMOX1,BIGH3)のサブセットのためのELISAアッセイは高い健康な対照個体(曲線下面積は受信者動作特性における0.98)からGBM患者の分離を明らかにした。添加では,これら四種類の蛋白質に基づく分類器は術前・後腫瘍切除の血液を区別し,バイオマーカーとしての可能性臨床的価値を示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *タンパク質 ,  膜貫通タンパク質 ,  プロテオミクス ,  *膠芽腫 ,  バイオマーカー ,  ELISA ,  遺伝子 ,  患者 ,  相関係数 ,  腫瘍切除 ,  血漿 ,  切除術
準シソーラス用語： 臨床評価 ,  TGF-βシグナル伝達 ,  トランスクリプトーム解析 ,  *細胞表面 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： GBM ,  細胞表面蛋白質 ,  GBMSig ,  侵入

分類 (2件)： 神経系の腫よう  (GN04000V) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (4件)： 神経膠芽腫 ,  細胞表面 ,  膜蛋白質 ,  シグネチャ