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J-GLOBAL ID：201702288128969861   整理番号：17A1170011

RNAガイドと標的DNAと複合体を形成したFrancisella novicida Cpf1エンドヌクレアーゼの集合【Powered by NICT】

Assembly of Francisella novicida Cpf1 endonuclease in complex with guide RNA and target DNA

著者 (3件)： Alcon Pablo (Protein Structure and Function Programme, The Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Blegdamsvej 3b, 2200Copenhagen, Denmark) ,  Montoya Guillermo (Protein Structure and Function Programme, The Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Blegdamsvej 3b, 2200Copenhagen, Denmark) ,  Stella Stefano (Protein Structure and Function Programme, The Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Blegdamsvej 3b, 2200Copenhagen, Denmark)
資料名： Acta Crystallographica Section F  (Acta Crystallographica Section F)
巻： 73  号： 7  ページ： 409-415  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2479A  ISSN： 2053-230X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細菌と古細菌は外因性核酸による感染に対する適応応答としてのCRISPR-Casシステムを用いた。顕著な柔軟性のために,この機構はゲノム編集のための強力なツールとして利用と採用されている。CRISPR-Casシステムは六種類,cas遺伝子と遺伝子座組織の保存に従って19サブタイプに分けられることを二クラスを含んでいる。最近,クラス2V型に属するエンドヌクレアーゼ活性を持つ新規蛋白質を同定した。単一CRISPR RNA(crRNA)と複合体を形成したこのエンドヌクレアーゼ,Cpf1と呼ばれる,はRNAガイドへの5′-TTN RNA3′protospacer adjacent motif(PAM)相補が先行した標的DNAを認識し,切断することができた。Cpf1の内部動作への構造的洞察を得るために,crRNAと31 ヌクレオチドdsDNA標的の全範囲を含む活性複合体の結晶化を試みた。Francisella novicidaからの遺伝子をコードするCpf1をクローン化し,過剰発現させ,精製した。crRNAはin vitroで転写され,精製した。最後に,三元FnCpf1crRNA DNA複合体は結晶化前に分取電気泳動によって集合させ,精製した。,単位格子パラメータは=85.2Å,137.6Å,320.5Å,空間群C222_1に属する結晶が得られ,予備的回折実験を行った。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 柔軟性 ,  *エンドヌクレアーゼ ,  タンパク質 ,  *RNA【核酸】 ,  結晶化 ,  in vitro実験 ,  *DNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  細菌 ,  ヌクレオチド ,  *複合体 ,  古細菌
準シソーラス用語： CRISPR配列 ,  CRISPR-Casシステム ,  *Francisella novicida , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 結晶化 ,  蛋白質-DNA相互作用 ,  蛋白質-RNA相互作用 ,  データ収集 ,  ゲノム編集 ,  CRISPR-Cas

分類 (1件)： 遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (7件)： RNA ,  標的 ,  DNA ,  複合体 ,  Francisella ,  エンドヌクレアーゼ ,  集合