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J-GLOBAL ID：201702288153344381   整理番号：17A0445007

臨床微生物学と感染防止における次世代シーケンシングの応用【Powered by NICT】

Application of next generation sequencing in clinical microbiology and infection prevention

著者 (14件)： Deurenberg Ruud H. (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Bathoorn Erik (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Chlebowicz Monika A. (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Couto Natacha (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Ferdous Mithila (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Garcia-Cobos Silvia (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Kooistra-Smid Anna M.D. (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Kooistra-Smid Anna M.D. (Certe, Department of Medical Microbiology, Groningen, The Netherlands) ,  Raangs Erwin C. (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Rosema Sigrid (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Veloo Alida C.M. (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Zhou Kai (State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The First Affiliated Hospital of Medicine School, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Friedrich Alexander W. (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands) ,  Rossen John W.A. (Department of Medical Microbiology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, The Netherlands)
資料名： Journal of Biotechnology  (Journal of Biotechnology)
巻： 243  ページ： 16-24  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0456C  ISSN： 0168-1656  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト病原体の現在の分子診断は発生と透過研究のための十分なされないことが多いことを限られた情報を提供する。次世代シークエンシング(NGS)は,単一の連続実行での完全な細菌ゲノムのDNA配列を決定し,これらのデータから,抵抗性と病原性に関する情報だけでなく,タイピングのための情報が得られ,発生研究に有用である。得られたゲノムデータは発生特異的スクリーニング試験の開発のために使用することができる。本レビューでは,NGSへの一般的紹介を示し,ライブラリー調製と最も一般的なNGSプラットフォームの主要な特徴を含めて,MiSeq(Illumina)とイオンPGM(ThermoFisher)である。NGSデータ用ソフトの概観はin大学医療センターGroningenの医学微生物診断研究所で用いられている解析オランダを与えた。さらに,臨床設定におけるNGSの応用について述べ,流行管理,分子症例発見,病原体の特徴分析とサーベイランス,16S-23S rRNA領域を用いた細菌の迅速な同定,分類,臨床試料のメタゲノミクスアプローチ,動物からヒトへの人畜共通微生物の透過の定量などである。最後に,近い将来個別化微生物学におけるNGSの使用に関する著者らのビジョンを共有し,特定の要件を示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 病原性 ,  *微生物学 ,  *微生物 ,  ヒト ,  オランダ王国 ,  スクリーニング ,  病原体 ,  サーベイランス
準シソーラス用語： 23S rRNA ,  DNA配列 ,  細菌ゲノム ,  次世代シークエンシング ,  分子診断 ,  *感染対策 ,  *臨床微生物学 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 感染予防 ,  イオンPGM~ ,  臨床微生物学 ,  MiSeq ,  次世代配列決定 ,  全ゲノム配列決定

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (4件)： 臨床微生物学 ,  感染防止 ,  次世代シーケンシング ,  応用