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J-GLOBAL ID：201702288516612359   整理番号：17A1742606

群集カタログが明らかにする地球のマルチスケールの微生物多様性

A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity

著者 (120件)： THOMPSON Luke R. (Univ. California San Diego, California, USA) ,  SANDERS Jon G. (Univ. California San Diego, California, USA) ,  MCDONALD Daniel (Univ. California San Diego, California, USA) ,  AMIR Amnon (Univ. California San Diego, California, USA) ,  TRIPATHI Anupriya (Univ. California San Diego, California, USA) ,  ACKERMANN Gail (Univ. California San Diego, California, USA) ,  NAVAS-MOLINA Jose A. (Univ. California San Diego, California, USA) ,  JANSSEN Stefan (Univ. California San Diego, California, USA) ,  KOPYLOVA Evguenia (Univ. California San Diego, California, USA) ,  VAZQUEZ-BAEZA Yoshiki (Univ. California San Diego, California, USA) ,  GONZALEZ Antonio (Univ. California San Diego, California, USA) ,  MORTON James T. (Univ. California San Diego, California, USA) ,  XU Zhenjiang Zech (Univ. California San Diego, California, USA) ,  JIANG Lingjing (Univ. California San Diego, California, USA) ,  KANBAR Jad (Univ. California San Diego, California, USA) ,  ZHU Qiyun (Univ. California San Diego, California, USA) ,  SONG Se Jin (Univ. California San Diego, California, USA) ,  KOSCIOLEK Tomasz (Univ. California San Diego, California, USA) ,  LEFLER Joshua (Univ. California San Diego, California, USA) ,  HUMPHREY Gregory (Univ. California San Diego, California, USA) ,  KNIGHT Rob (Univ. California San Diego, California, USA) ,  THOMPSON Luke R. (Univ. Southern Mississippi, Mississippi, USA) ,  THOMPSON Luke R. (National Oceanic and Atmospheric Administration, California, USA) ,  GOODWIN Kelly D. (National Oceanic and Atmospheric Administration, California, USA) ,  LADAU Joshua (Univ. California San Francisco, California, USA) ,  POLLARD Katherine S. (Univ. California San Francisco, California, USA) ,  LOCEY Kenneth J. (Indiana Univ., Indiana, USA) ,  PRILL Robert J. (IBM Almaden Res. Center, California, USA) ,  GIBBONS Sean M. (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  GIBBONS Sean M. (Broad Inst., MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  MIRARAB Siavash (Univ. California San Diego, California, USA) ,  HAROON Mohamed F. (Harvard Univ., Massachusetts, USA) ,  BOKULICH Nicholas A. (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  BRISLAWN Colin J. (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  JANSSON Janet K. (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  OWENS Sarah M. (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  HAMPTON-MARCELL Jarrad (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  GILBERT Jack A. (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  HAMPTON-MARCELL Jarrad (Univ. Illinois at Chicago, Illinois, USA) ,  BERG-LYONS Donna (Univ. Colorado, Colorado, USA) ,  CLAUSET Aaron (Univ. Colorado, Colorado, USA) ,  MCKENZIE Valerie (Univ. Colorado, Colorado, USA) ,  FIERER Noah (Univ. Colorado, Colorado, USA) ,  FUHRMAN Jed A. (Univ. Southern California, California, USA) ,  STEVENS Rick L. (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  STEVENS Rick L. (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  SHADE Ashley (Michigan State Univ., Michigan, USA) ,  GILBERT Jack A. (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  RIVERA Jose L. Agosto (Univ. Puerto Rico, Puerto Rico, USA) ,  GARCIA Liza (Univ. Puerto Rico, Puerto Rico, USA) ,  GIRAY Tugrul (Univ. Puerto Rico, Puerto Rico, USA) ,  CASTELLANO Yadira Ortiz (Univ. Puerto Rico, Puerto Rico, USA) ,  VARGAS-ROBLES Daniela (Univ. Puerto Rico, Puerto Rico, USA) ,  AL-MOOSAWI Lisa (Plymouth Marine Lab., Plymouth, GBR) ,  FINDLAY Helen S. (Plymouth Marine Lab., Plymouth, GBR) ,  REES Andrew P. (Plymouth Marine Lab., Plymouth, GBR) ,  TAIT Karen (Plymouth Marine Lab., Plymouth, GBR) ,  ALVERDY John (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  CARDONA Cesar (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  COLEMAN Maureen L. (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  DEFAZIO Jennifer (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  GUYTON Kristina (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  KREZALEK Monika (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  LANDON Emily M. (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  LAX Simon (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  MEYER Folker (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  PFISTER Catherine (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  RICHARDSON Miles (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  SANGWAN Naseer (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  SHAKHSHEER Baddr (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  SHOGAN Benjamin D. (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  AMATO Katherine R. (Northwestern Univ., Illinois, USA) ,  ANDRAS Jason (Mount Holyoke Coll., Massachusetts, USA) ,  BALLANTINE Kate (Mount Holyoke Coll., Massachusetts, USA) ,  ANGENENT Largus T. (Cornell Univ., New York, USA) ,  FORSMAN Anna (Cornell Univ., New York, USA) ,  FRIEDMAN Elliot S. (Cornell Univ., New York, USA) ,  SPIRITO Catherine M. (Cornell Univ., New York, USA) ,  WERNER Jeffrey J. (Cornell Univ., New York, USA) ,  ANGENENT Largus T. (Univ. Tuebingen, Tuebingen, DEU) ,  LIANCOURT Pierre (Univ. Tuebingen, Tuebingen, DEU) ,  ANTONOPOULOS Dionysios A. (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  JASTROW Julie D. (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  LARSEN Peter (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  MEYER Folker (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  O’BRIEN Sarah L. (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  WEISENHORN Pamela (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  APPRILL Amy (Woods Hole Oceanographic Institution, Massachusetts, USA) ,  ARMITAGE David (Univ. California Berkeley, California, USA) ,  DUBINSKY Eric A. (Univ. California Berkeley, California, USA) ,  KAUPPINEN Seth (Univ. California Berkeley, California, USA) ,  ARMITAGE David (Univ. Notre Dame, Indiana, USA) ,  BARTA Jiri (Univ. South Bohemia, Ceske Budejovice, CZE) ,  BAUM Julia K. (Univ. Victoria, British Columbia, CAN) ,  CLAAR Danielle C. (Univ. Victoria, British Columbia, CAN) ,  MCDEVITT-IRWIN Jamie M. (Univ. Victoria, British Columbia, CAN) ,  BERRY Allison (Univ. California Davis, California, USA) ,  GIFFORD Isaac (Univ. California Davis, California, USA) ,  MILLS David A. (Univ. California Davis, California, USA) ,  WHITEHEAD Andrew (Univ. California Davis, California, USA) ,  BHATNAGAR Ashish (Maharshi Dayanand Saraswati Univ., Ajmer, IND) ,  BHATNAGAR Monica (Maharshi Dayanand Saraswati Univ., Ajmer, IND) ,  BIDDLE Jennifer F. (Univ. Delaware, Delaware, USA) ,  BITTNER Lucie (Univ. Pierre et Marie Curie, Paris, FRA) ,  BOLDGIV Bazartseren (National Univ. Mongolia, Ulaanbaatar, MNG) ,  BOTTOS Eric (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  HOFMOCKEL Kirsten S. (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  BOYER Donal M. (Wildlife Conservation Soc. and Bronx Zoo, New York, USA) ,  BRAUN Josephine (San Diego Zoo Inst. for Conservation Res., California, USA) ,  BRAZELTON William (Univ. Utah, Utah, USA) ,  BREARLEY Francis Q. (Manchester Metropolitan Univ., Manchester, GBR) ,  CAMPBELL Alexandra H. (Univ. New South Wales, New South Wales, AUS) ,  JOSEPH Stephen (Univ. New South Wales, New South Wales, AUS) ,  MARZINELLI Ezequiel M. (Univ. New South Wales, New South Wales, AUS) ,  MOITINHO-SILVA Lucas (Univ. New South Wales, New South Wales, AUS) ,  MUNROE Paul (Univ. New South Wales, New South Wales, AUS) ,  NIELSEN Shaun (Univ. New South Wales, New South Wales, AUS) ,  STEINBERG Peter D. (Univ. New South Wales, New South Wales, AUS) ,  THOMAS Torsten (Univ. New South Wales, New South Wales, AUS) ,  VAN ZWIETEN Lukas (Univ. New South Wales, New South Wales, AUS)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 551  号： 7681  ページ： 457-463  発行年： 2017年11月23日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 微生物の世界の重要性や多様性に対する関心が高まっていることとは全く対照的に,微生物世界の基本的な構造についての我々の理解は限られている。最近,DNA塩基配列解読法が進歩しているが,標準化されたプロトコルや解析の一般的枠組みがないことが研究間での比較を妨げ,地球上の微生物という生命体に関して全球的な推定を行う障害となっている。今回我々は,地球マイクロバイオームプロジェクトの数百人の研究者により採取された微生物群集試料の,メタ解析結果を報告する。調整されたプロトコルや新しい解析法[特に,操作的分類単位(OTU)によるクラスタリングではなく,正確な塩基配列を用いる方法など]により,細菌やアーキアのリボソームRNA遺伝子の塩基配列を多数の研究間で追跡でき,また,前例のない規模での多様性パターンの探索が可能になった。この結果は,DNA塩基配列データに全球的状況を加えた参照データベースにも,将来の研究のデータを取り込むための枠組みにもなり,地球の微生物多様性の全特性を次第に明らかにすることを促すだろう。Copyright Nature Japan KK 2018

シソーラス用語： *地球 ,  *生物多様性 ,  *微生物 ,  *DNA【核酸】 ,  *ヌクレオチド配列 ,  ゲノム ,  群集 ,  メタ分析 ,  プロトコル ,  クラスタ化 ,  細菌 ,  古細菌 ,  rRNA ,  遺伝子 ,  データベース ,  *微生物多様性 ,  マイクロバイオーム ,  *惑星 ,  改変
準シソーラス用語： *塩基配列 ,  微生物群集 ,  メタ解析 ,  クラスタリング ,  Archaea ,  リボソームRNA

分類 (3件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 群集 ,  カタログ ,  地球 ,  マルチスケール ,  微生物多様性