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J-GLOBAL ID：201702288651344241   整理番号：17A1191096

高悪性度膀胱癌におけるエピゲノムワイドDNAメチル化プロファイリングは異なるメチル化バイオマーカー【Powered by NICT】

Epigenome-Wide DNA Methylation Profiling Identifies Differential Methylation Biomarkers in High-Grade Bladder Cancer

著者 (18件)： Olkhov-Mitsel Ekaterina (Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Sinai Health System, 60 Murray St., Toronto, Ontario, Canada, M5T 3L9) ,  Olkhov-Mitsel Ekaterina (Department of Laboratory Medicine and Pathobiology, University of Toronto, 27 King’s College Circle, Toronto, Ontario, Canada, M5S 1A1) ,  Savio Andrea J. (Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Sinai Health System, 60 Murray St., Toronto, Ontario, Canada, M5T 3L9) ,  Savio Andrea J. (Department of Laboratory Medicine and Pathobiology, University of Toronto, 27 King’s College Circle, Toronto, Ontario, Canada, M5S 1A1) ,  Kron Ken J. (Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Sinai Health System, 60 Murray St., Toronto, Ontario, Canada, M5T 3L9) ,  Kron Ken J. (Department of Laboratory Medicine and Pathobiology, University of Toronto, 27 King’s College Circle, Toronto, Ontario, Canada, M5S 1A1) ,  Pethe Vaijayanti V. (Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Sinai Health System, 60 Murray St., Toronto, Ontario, Canada, M5T 3L9) ,  Hermanns Thomas (Department of Surgery and Surgical Oncology, Division of Urology, The Princess Margaret Cancer Centre, University Health Network, 610 University Ave., Toronto, Ontario, Canada, M5G 2M9) ,  Fleshner Neil E. (Department of Surgery and Surgical Oncology, Division of Urology, The Princess Margaret Cancer Centre, University Health Network, 610 University Ave., Toronto, Ontario, Canada, M5G 2M9) ,  van Rhijn Bas W. (Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Sinai Health System, 60 Murray St., Toronto, Ontario, Canada, M5T 3L9) ,  van Rhijn Bas W. (Department of Surgery and Surgical Oncology, Division of Urology, The Princess Margaret Cancer Centre, University Health Network, 610 University Ave., Toronto, Ontario, Canada, M5G 2M9) ,  van der Kwast Theodorus H. (Department of Laboratory Medicine and Pathobiology, University of Toronto, 27 King’s College Circle, Toronto, Ontario, Canada, M5S 1A1) ,  van der Kwast Theodorus H. (Department of Pathology, University Health Network, 200 Elizabeth St., Toronto, Ontario, Canada, M5G 2C4) ,  Zlotta Alexandre R. (Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Sinai Health System, 60 Murray St., Toronto, Ontario, Canada, M5T 3L9) ,  Zlotta Alexandre R. (Department of Surgery, Division of Urology, Sinai Health System, 600 University Ave., Toronto, Ontario, Canada, M5G 1X5) ,  Bapat Bharati (Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Sinai Health System, 60 Murray St., Toronto, Ontario, Canada, M5T 3L9) ,  Bapat Bharati (Department of Laboratory Medicine and Pathobiology, University of Toronto, 27 King’s College Circle, Toronto, Ontario, Canada, M5S 1A1) ,  Bapat Bharati (Department of Pathology, University Health Network, 200 Elizabeth St., Toronto, Ontario, Canada, M5G 2C4)
資料名： Translational Oncology  (Translational Oncology)
巻： 10  号： 2  ページ： 168-177  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2898A  ISSN： 1936-5233  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： CpGアイランド過剰メチル化を含む後成的変化は,膀胱癌(BC)においてしばしば起り,高悪性度(HG)と低品位(LG)疾患とのBC検出と識別のために利用される可能性がある。ゲノムワイドメチル化分析は,LGとHG例間の後成的相違を決定するために,AgilentヒトCpG島マイクロアレイを用いて行った。経路濃縮分析と機能的アノテーションはHG BCで最も高頻度にメチル化された経路は,前方/後方パターン仕様,はい骨格システム開発,ニューロン運命決定,DNA結合および転写因子活性を濃縮したことを明らかにした。メチル化に基づくHGからLGを識別し完全に32 ゲンパネルからなる990のプローブを同定した。EOMES,GP5,PAX6,TCF4,ZSCAN12,このパネルからの選択された遺伝子は,正常な膀胱試料とLGとHG例の独立系列(n=84)におけるMethyLightによる定量的ポリメラーゼ連鎖反応に基づく検証のために選択した。BCにおける二種類の新規メチル化遺伝子,GP5とZSCAN12は有意にHG対LG BC(P≦.03)で過剰メチル化された。からLGとHG BC例(n=42)の第二の独立したコホートにおける著者らのデータを検証した癌ゲノムアトラス(TCGA)。32 ゲンパネルを表すプローブは有意にLGとHG腫瘍(P≦.04)でメチル化され異なっていた。これらの結果は,癌から正常組織だけでなく,HGからLG,メチル化に基づいて識別する能力を示し,HG BCにおける調節不全の重要な経路を明らかにした。著者らの知見は,TCGAから公的に利用可能なデータセットを用いて確認した。疾患表現型を区別することができ,GP5とZSCAN12を含むメチル化パネルの創出は,疾患管理と患者転帰を改善するであろう。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 表現型 ,  プローブ ,  ヒト ,  *膀胱腫瘍 ,  PCR法 ,  ニューロン ,  *メチル化 ,  *バイオマーカー ,  患者 ,  遺伝子 ,  転写因子 ,  *膀胱
準シソーラス用語： マイクロアレイ ,  CpGアイランド ,  *DNAメチル化 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 悪性度 ,  膀胱癌 ,  エピゲノム ,  DNAメチル化 ,  プロファイリング ,  メチル化 ,  バイオマーカー