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J-GLOBAL ID：201702288823718842   整理番号：17A1083270

ISWIクロマチンリモデリング因子はヌクレオソームの修飾を感知してどの基質を選ぶかを決める

ISWI chromatin remodellers sense nucleosome modifications to determine substrate preference

著者 (14件)： DANN Geoffrey P. (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  LISZCZAK Glen P. (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  BAGERT John D. (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  MUELLER Manuel M. (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  NGUYEN Uyen T. T. (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  WOJCIK Felix (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  BROWN Zachary Z. (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  BOS Jeffrey (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  PIHL Rasmus (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  POLLOCK Samuel B. (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  DIEHL Katharine L. (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  MUIR Tom W. (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  PANCHENKO Tatyana (Rockefeller Univ., New York, USA) ,  ALLIS C. David (Rockefeller Univ., New York, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 548  号： 7669  ページ： 607-611  発行年： 2017年08月31日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ATP依存性クロマチンリモデリング因子は,in vivoでのヌクレオソームの位置を制御することで,遺伝情報への接近しやすさを調節している。しかし,基質である多様なヌクレオソームをリモデリング因子が見分ける機構については,ほとんど分かっていない。多くのクロマチンリモデリングタンパク質には保存されたタンパク質ドメインがあり,これらがヌクレオソームの特徴と相互作用する。本研究では,DNAをバーコード化したモノヌクレオソームライブラリーの使用を基盤とする定量的でハイスループットの手法を用い,ヒトISWIファミリーリモデリング因子群について,さまざまなヌクレオソーム修飾セットに応じて生じる生化学的活性のプロファイリングを行った。ISWIリモデリング因子の補助的(非ATPアーゼ)サブユニット群は修飾のされ方が違うヌクレオソームを識別でき,それらの修飾状態に応じて,リモデリング活性を特定の基質ヌクレオソームへと向けることが明らかになった。意外なことに,評価した全てのISWIリモデリング因子で,その最大活性にはヌクレオソームの酸性パッチが必要であることが分かった。この依存性は,CHDやSWI/SNFファミリーのリモデリング因子でも同様であり,このことは酸性パッチがクロマチンリモデリングに広く必要とされる可能性を示唆している。酸性パッチ近傍の修飾によりリモデリング活性が調節できることが明らかになったのは重要で,これは酸性パッチがATP依存性クロマチンリモデリング因子,さらにはヌクレオソーム表面のこの領域に結合している他の多くのクロマチンエフェクターに対してもおそらく,調節可能な相互作用ホットスポットとして働く可能性を示唆している。Copyright Nature Japan KK 2018

シソーラス用語： *タンパク質複合体 ,  *ヌクレオソーム ,  *分子間相互作用 ,  バーコード ,  特徴抽出 ,  活性 ,  構造 ,  高エネルギーリン酸化合物 ,  ホットスポット ,  アデニンヌクレオチド ,  リボヌクレオチド
準シソーラス用語： DNAバーコード化 ,  *ISWIクロマチンリモデリング因子 ,  クロマチンリモデリング因子 ,  *プロファイリング ,  リモデリング活性 ,  *酸性パッチ ,  相互作用ホットスポット

分類 (3件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  細胞構成体一般  (EF03010Z)

物質索引 (1件)： ATP【ヌクレオチド】

タイトルに関連する用語 (5件)： クロマチンリモデリング因子 ,  ヌクレオソーム ,  修飾 ,  感知 ,  基質