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J-GLOBAL ID：201702289373118324   整理番号：17A1520872

ダイズKUP/HAK/KTカリウム輸送体遺伝子ファミリーの同定と発現解析【JST・京大機械翻訳】

Identification and Expression Analysis of KUP/HAK/KT Potassium Transporter Gene Family in Soybean [Glycine max (L.)Merr.]

著者 (6件)： Chao Maoni (河南科技学院,現代生物育種河南省協同創新中心,河南新郷 453003) ,  Wen Qingyu (河南省農業科学院,鄭州,450002) ,  Zhang Jinyu (河南科技学院,現代生物育種河南省協同創新中心,河南新郷 453003) ,  Zhang Zhiyong (河南科技学院,現代生物育種河南省協同創新中心,河南新郷 453003) ,  Dong Jie (河南科技学院,現代生物育種河南省協同創新中心,河南新郷 453003) ,  Yu Yaxin (河南科技学院,現代生物育種河南省協同創新中心,河南新郷 453003)
資料名： Xibei Zhiwu Xuebao  (Xibei Zhiwu Xuebao)
巻： 37  号： 2  ページ： 239-241,244-249  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2196A  ISSN： 1000-4025  CODEN： XZXUEV  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究では、公表された大豆ゲノム配列情報に基づき、ダイズKUP/HAK/KTカリウム輸送体遺伝子ファミリーに対して全ゲノム同定を行い、そのファミリーメンバーの遺伝子特徴、タンパク構造、染色体定位、遺伝子複製と発現パターンなどについて全面的に分析した。この遺伝子ファミリーの機能を理解し、カリウムの高効率なダイズ品種を育成するために、理論的なサポートを提供する。結果は以下を示した。(1)ダイズゲノムにおいて,30のKUP/HAK/KT遺伝子(GmHAK01-GmHAK 30)を同定し,これらの遺伝子はダイズの15の染色体に分布し,GmHAKs遺伝子はダイズゲノムにおいて増幅される可能性がある。(2)ダイズGmHAKs蛋白質間の配列は一貫性が高く、いずれも12~14個の膜貫通領域があり、いずれも原形質膜上に位置している。(3)進化分析によると、ダイズGmHAKsは4つの進化クラスターCluster I~IVに集約でき、そのうちCluCluIIのメンバー数は最も多く(16個)、Cluster IVのメンバー数は最も少ない(1個)。(4)すべてのGmHAKs遺伝子はイントロンとエクソンを含み、そのイントロンの数は7~9個の間にあり、しかも同じサブファミリーのGmHAKs遺伝子は大部分が類似の内-エクソン分布パターンを持っている。(5)発現パターン分析により、大豆GmHAKsの発現は大体2種類に分けられることが明らかになった。一部は組織特異的に発現された遺伝子であり、Cluster IとCluster IVの全メンバー、Cluster IIの一部のメンバーを含むものが含まれている.1種は遺伝子を発現することができる.1種の遺伝子を含んでいることが知られている。彼らは根(GmHAK 30とGmHAK 04)、花(GmHAK 03とGmHAK 15)、莢(Gm-HAK 10)または種子(GmHAK 25)において発現量が高かった。もう一つは、一部の非組織特異的に発現する遺伝子であり、Cluster IIIの全メンバーとCluster IIの一部のメンバーを含み、これらの遺伝子(GmHAK、GmHAK 17、GmHAK28など)はすべての検査された組織において高い発現がある。... . . . . . . . . . . . . . . .はすべて発現されていることを示している。KUP/HAK/KTファミリーの遺伝子発現パターンは異なる進化クラスターの差異化の結果により、進化過程において選択の作用を受ける可能性があることが明らかになった。これらの結果は,KUP/HAK/KTファミリーの遺伝子機能を研究し,ダイズのカリウム吸収特性を改良するための重要な遺伝子情報を提供し,ダイズのカリウムの高効率品種の育種に対する理論的基礎を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *カリウム ,  細胞膜 ,  *遺伝子 ,  タンパク質 ,  *ダイズ ,  クラスタ ,  品種 ,  イントロン ,  ゲノム
準シソーラス用語： 遺伝子機能 ,  遺伝子発現パターン ,  ゲノム配列 ,  *遺伝子発現プロファイリング ,  *遺伝子ファミリー ,  *カリウム輸送体 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： gene family ,  KUP/HAK/KT gene ,  phylogenetic analysis ,  expression pattern ,  soybean

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  豆類  (FC03035U)

タイトルに関連する用語 (5件)： ダイズ ,  カリウム輸送体 ,  遺伝子ファミリー ,  同定 ,  発現解析